135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1685 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  97.75 
 
 		 267 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  95.85 
 
 		 267 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  95.85 
 
 		 267 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  95.85 
 
 		 267 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  95.11 
 
 		 267 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  93.21 
 
 		 267 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  90.57 
 
 		 272 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  90.57 
 
 		 272 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  89.43 
 
 		 272 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  90.57 
 
 		 272 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  90.57 
 
 		 272 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  90.57 
 
 		 272 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  90.57 
 
 		 272 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  90.57 
 
 		 272 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  80.92 
 
 		 268 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2323  ABC transporter, inner membrane subunit  80.99 
 
 		 268 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0986  hypothetical protein  80.68 
 
 		 268 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  67.43 
 
 		 269 aa  338  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  67.18 
 
 		 269 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0748  hypothetical protein  66.79 
 
 		 272 aa  314  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  55.56 
 
 		 266 aa  245  6e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  46.74 
 
 		 264 aa  208  9e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  46.06 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  42.32 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2410  hypothetical protein  43.02 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  40.84 
 
 		 268 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0165  hypothetical protein  46.96 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.980165  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0076  hypothetical protein  41.18 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0298659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0121  hypothetical protein  40.75 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2104  hypothetical protein  43.86 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  38.98 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  40.32 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  40.24 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  43.4 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  40.93 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3122  hypothetical protein  40.42 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.859294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  34.75 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000359378  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04990  conserved hypothetical protein  37.31 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.804578  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0080  ABC transporter permease  37.86 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  40.31 
 
 		 261 aa  168  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  38.62 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  38.29 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  37.25 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  35.16 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  37.13 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  37.25 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2020  hypothetical protein  38.53 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  35.97 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  38.15 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  37.94 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  32.28 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  36.61 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1218  hypothetical protein  34.9 
 
 		 258 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  37.44 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7995  hypothetical protein  37.74 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2239  hypothetical protein  37.74 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255232  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  35.66 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  39.38 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  37.44 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  37.44 
 
 		 265 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  37.44 
 
 		 265 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  37 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  37 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  37 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  37 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  37 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15630  conserved hypothetical protein TIGR00245  40.09 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  35.22 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  36.02 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000207096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  36.02 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000302353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  34.07 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0700  hypothetical protein  37 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  36.25 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0689  hypothetical protein  31.25 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.393246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  39.11 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1097  hypothetical protein  34.39 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0072  hypothetical protein  38.83 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  41.23 
 
 		 266 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15102  predicted protein  35.51 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2290  hypothetical protein  39.53 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000247425 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0426  hypothetical protein  30.12 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  30.12 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3119  conserved hypothetical protein  30.12 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0570  hypothetical protein  30.12 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0530  hypothetical protein  30.12 
 
 		 259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00447  hypothetical protein  30.12 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3125  hypothetical protein  30.12 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0540  hypothetical protein  30.12 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  30.12 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  30.34 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  30.34 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  30.34 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  30.34 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  30.34 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0169  ABC transporter, permease protein, putative  39.3 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645871  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2859  hypothetical protein  36.29 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0934  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.29 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000794066  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4666  hypothetical protein  29.63 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A09  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.66 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000000112109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>