More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1558 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.79 
 
 		 2138 aa  701    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02621  N-(5-amino-5-carboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D- valine synthase (EC 6.3.2.26)(Delta-(L-alpha-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D- valine synthetase)(ACV synthetase)(ACVS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27742]  28.48 
 
 		 3770 aa  646    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.830211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  35.05 
 
 		 3470 aa  808    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  41.01 
 
 		 2628 aa  1547    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  34.87 
 
 		 2174 aa  762    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.5 
 
 		 4317 aa  1610    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  35.52 
 
 		 3348 aa  793    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  36.12 
 
 		 5953 aa  855    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.73 
 
 		 6889 aa  883    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.17 
 
 		 2385 aa  728    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.55 
 
 		 4336 aa  1682    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  40.44 
 
 		 2625 aa  1705    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  35.95 
 
 		 2151 aa  825    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  42.39 
 
 		 2875 aa  1851    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  34.35 
 
 		 3291 aa  942    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  35.41 
 
 		 5929 aa  781    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  67.13 
 
 		 3294 aa  3789    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  32.78 
 
 		 3432 aa  800    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.75 
 
 		 4531 aa  846    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.47 
 
 		 2385 aa  742    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  37.18 
 
 		 1726 aa  734    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  31.72 
 
 		 2385 aa  744    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1715  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  26.47 
 
 		 2543 aa  1004    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1716  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  26.68 
 
 		 3044 aa  1036    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1717  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  27.37 
 
 		 2295 aa  862    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  32.03 
 
 		 2385 aa  746    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  34.65 
 
 		 6272 aa  747    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  37.24 
 
 		 3328 aa  741    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2097  amino acid adenylation domain-containing protein  26.46 
 
 		 1992 aa  697    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  34.96 
 
 		 3021 aa  796    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  36.22 
 
 		 4336 aa  1632    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  40.65 
 
 		 2666 aa  1688    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  36.1 
 
 		 2154 aa  813    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  43.33 
 
 		 2883 aa  1860    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  35.17 
 
 		 3962 aa  1341    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  35.81 
 
 		 5926 aa  808    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  34.2 
 
 		 9498 aa  829    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  33.53 
 
 		 5372 aa  769    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.73 
 
 		 8646 aa  860    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  34.62 
 
 		 13537 aa  845    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  35.28 
 
 		 6676 aa  879    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  38.15 
 
 		 3231 aa  1671    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  36.24 
 
 		 3629 aa  905    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  40.94 
 
 		 5467 aa  1508    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  28.91 
 
 		 3395 aa  1371    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  33.07 
 
 		 3308 aa  858    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  33.43 
 
 		 3498 aa  1328    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  34.74 
 
 		 2033 aa  1065    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  67.21 
 
 		 3287 aa  3799    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  67.27 
 
 		 3290 aa  3787    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  34.54 
 
 		 6274 aa  744    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2663  nonribosomal peptide synthetase  34.2 
 
 		 2979 aa  979    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  34.6 
 
 		 6271 aa  746    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  34.41 
 
 		 6072 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  34.35 
 
 		 4572 aa  804    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  35.47 
 
 		 3291 aa  789    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  41.51 
 
 		 5654 aa  1451    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  37.6 
 
 		 4502 aa  1774    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  39.84 
 
 		 3235 aa  1720    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  33.55 
 
 		 5422 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  34.21 
 
 		 4882 aa  782    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  34.73 
 
 		 3002 aa  807    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.53 
 
 		 4332 aa  1691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  91.12 
 
 		 3219 aa  5433    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.47 
 
 		 2385 aa  742    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  38.66 
 
 		 4037 aa  1605    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  32.4 
 
 		 1801 aa  664    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1956  non-ribosomal peptide synthetase, putative  34.75 
 
 		 2967 aa  1034    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  31.65 
 
 		 3650 aa  1013    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  66.59 
 
 		 3296 aa  3796    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  34.31 
 
 		 4290 aa  745    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  34.71 
 
 		 4489 aa  715    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  34.5 
 
 		 2605 aa  788    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2461  amino acid adenylation  34.31 
 
 		 4606 aa  918    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.782467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  32.75 
 
 		 3102 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  66.87 
 
 		 3180 aa  3949    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  34.02 
 
 		 4468 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  26.26 
 
 		 2457 aa  708    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  91.34 
 
 		 3231 aa  5405    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  97.43 
 
 		 3227 aa  5695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  35.03 
 
 		 3176 aa  1129    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  35.35 
 
 		 3018 aa  1097    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  33.4 
 
 		 6006 aa  757    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  37.31 
 
 		 4342 aa  1688    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  39.31 
 
 		 5149 aa  1834    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  35.69 
 
 		 2189 aa  801    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  36.13 
 
 		 2448 aa  808    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  37.67 
 
 		 5328 aa  1408    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  91.34 
 
 		 3231 aa  5405    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  29.26 
 
 		 2151 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  27.25 
 
 		 2894 aa  638    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  39.63 
 
 		 2651 aa  1377    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.87 
 
 		 2370 aa  827    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  34.56 
 
 		 6081 aa  813    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  67.07 
 
 		 3297 aa  3788    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2522  non-ribosomal peptide synthase  34.3 
 
 		 2979 aa  987    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207691  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  37.24 
 
 		 3352 aa  740    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2575  non-ribosomal peptide synthase  34.26 
 
 		 2979 aa  964    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  67.13 
 
 		 3294 aa  3789    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1927  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  67.16 
 
 		 3290 aa  3792    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>