More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1443 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 461 aa  919    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  91.65 
 
 		 443 aa  768    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  75.84 
 
 		 444 aa  664    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  71.91 
 
 		 441 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  70.92 
 
 		 443 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  70.79 
 
 		 441 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  70.79 
 
 		 441 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  70.79 
 
 		 441 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  70.79 
 
 		 441 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  70.69 
 
 		 443 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  70.69 
 
 		 443 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  70.69 
 
 		 443 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  71.86 
 
 		 432 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  71.86 
 
 		 432 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  71.86 
 
 		 432 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  67.62 
 
 		 468 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  66.43 
 
 		 454 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  53.2 
 
 		 454 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  53.2 
 
 		 454 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  50.93 
 
 		 454 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  50.94 
 
 		 457 aa  392  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  48.31 
 
 		 473 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  46.28 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  47.11 
 
 		 452 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  45.23 
 
 		 492 aa  330  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  45.89 
 
 		 478 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  45.89 
 
 		 478 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  40.84 
 
 		 453 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  39.06 
 
 		 483 aa  260  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  40 
 
 		 419 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  37.02 
 
 		 461 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  39.03 
 
 		 422 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  37.75 
 
 		 416 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  37.41 
 
 		 484 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  36.24 
 
 		 482 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  36.38 
 
 		 490 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  35.73 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  36.32 
 
 		 482 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  39.66 
 
 		 408 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  37.98 
 
 		 493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  38.78 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  38.43 
 
 		 419 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  38.67 
 
 		 416 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  36.11 
 
 		 526 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  36.26 
 
 		 460 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  34.77 
 
 		 487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  36.04 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  35.08 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  35.54 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3514  type II and III secretion system protein  40.07 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.91039  normal  0.283922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  33.89 
 
 		 493 aa  205  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  32.66 
 
 		 455 aa  203  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  35.47 
 
 		 496 aa  202  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  35.09 
 
 		 530 aa  197  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  36.08 
 
 		 482 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  36.08 
 
 		 482 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  36.08 
 
 		 482 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  36.08 
 
 		 482 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  36.08 
 
 		 482 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  36.34 
 
 		 492 aa  193  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  36.08 
 
 		 482 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  32.66 
 
 		 483 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  33.9 
 
 		 517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  33.25 
 
 		 466 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  32.61 
 
 		 499 aa  187  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  31.3 
 
 		 486 aa  187  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  32.19 
 
 		 479 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  32.62 
 
 		 574 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  32.3 
 
 		 539 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  32.41 
 
 		 461 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  32.71 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  32.41 
 
 		 461 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  32.61 
 
 		 497 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  33.16 
 
 		 466 aa  179  9e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  32.18 
 
 		 461 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  32.39 
 
 		 502 aa  176  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  32.32 
 
 		 480 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  33.44 
 
 		 622 aa  175  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  36.01 
 
 		 473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  33.11 
 
 		 571 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  31.9 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  30.61 
 
 		 480 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1727  type II and III secretion system protein  37.59 
 
 		 520 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  33.85 
 
 		 491 aa  172  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  32.39 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  30.07 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  31 
 
 		 494 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  32.31 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  34.1 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0707  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  32.72 
 
 		 423 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.848525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  31.9 
 
 		 497 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  32.55 
 
 		 501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  30.54 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  39.84 
 
 		 657 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  35.46 
 
 		 652 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  38.69 
 
 		 679 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  38.06 
 
 		 646 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  38.06 
 
 		 642 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  38.06 
 
 		 642 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>