110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1319 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
142 aa  298  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0095  hypothetical protein  69.11 
 
 
143 aa  186  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.29 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.14 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.31 
 
 
206 aa  70.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.28 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6095  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.58 
 
 
303 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.77 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.61 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.81 
 
 
397 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.07 
 
 
398 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  31.15 
 
 
330 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.67 
 
 
215 aa  55.5  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0905  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.61 
 
 
187 aa  54.3  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.04 
 
 
210 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.73 
 
 
209 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.343  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  29.27 
 
 
418 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.53 
 
 
253 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  30.33 
 
 
361 aa  51.6  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  27.91 
 
 
411 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3070  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  24.79 
 
 
230 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  32.23 
 
 
536 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3286  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.52 
 
 
251 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0799688  normal  0.416162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  31.25 
 
 
408 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.43 
 
 
370 aa  50.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  29.55 
 
 
574 aa  50.8  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.08 
 
 
235 aa  50.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  30.58 
 
 
503 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  31.4 
 
 
520 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.82 
 
 
214 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  30.63 
 
 
344 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
212 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.13 
 
 
250 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6758  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.47 
 
 
381 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  29.46 
 
 
521 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3373  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.63 
 
 
270 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  hitchhiker  0.00517308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.71 
 
 
247 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.56 
 
 
396 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.78 
 
 
413 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  30.58 
 
 
519 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3023  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.82 
 
 
214 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00777053  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.83 
 
 
628 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.91 
 
 
219 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  27.05 
 
 
575 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.63 
 
 
260 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.2 
 
 
217 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  31.15 
 
 
349 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.91 
 
 
368 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  30 
 
 
347 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2743  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.73 
 
 
269 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  30 
 
 
354 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.58 
 
 
374 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  27.64 
 
 
419 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.2 
 
 
481 aa  47.4  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.52 
 
 
272 aa  47.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  22.4 
 
 
307 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5913  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.43 
 
 
209 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.37 
 
 
376 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2040  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.09 
 
 
321 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0678  hypothetical protein  27.08 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.92298  normal  0.301667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  28.93 
 
 
496 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1993  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.93 
 
 
268 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.33 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2045  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  23.02 
 
 
211 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.07 
 
 
605 aa  46.2  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.69 
 
 
292 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.216205  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  24.59 
 
 
568 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  28.91 
 
 
507 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0647  hypothetical protein  28.03 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  26.23 
 
 
588 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1273  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.67 
 
 
193 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14942  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.83 
 
 
270 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  32.14 
 
 
264 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1444  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.7 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.69 
 
 
216 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3141  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.89 
 
 
238 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.849599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  29.09 
 
 
455 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.69 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.728522  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1577  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.57 
 
 
303 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000893286  normal  0.294184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4815  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.32 
 
 
217 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.08 
 
 
257 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.18 
 
 
415 aa  43.9  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  25.38 
 
 
493 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0089  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.36 
 
 
432 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1397  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.03 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.261472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1458  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  22.9 
 
 
406 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  27.05 
 
 
537 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5894  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.07 
 
 
375 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.5 
 
 
309 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  23.19 
 
 
520 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.84 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.47 
 
 
386 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0817  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.36 
 
 
295 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000447964  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1788  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.23 
 
 
190 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.76 
 
 
866 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07261  hypothetical protein  24.44 
 
 
243 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  23.62 
 
 
289 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1682  hypothetical protein  24.46 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.412549  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1014  hypothetical protein  29.46 
 
 
190 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00318676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.36 
 
 
183 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>