More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1315 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  98.08 
 
 		 156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  90.97 
 
 		 157 aa  290  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  90.97 
 
 		 156 aa  290  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  90.32 
 
 		 156 aa  286  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  85.9 
 
 		 156 aa  278  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  89.54 
 
 		 167 aa  275  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  77.63 
 
 		 158 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  78.38 
 
 		 160 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  78.38 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  78.38 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 160 aa  233  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 160 aa  233  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 160 aa  233  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  77.7 
 
 		 157 aa  233  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  69.86 
 
 		 149 aa  213  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  68.24 
 
 		 149 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  66.89 
 
 		 152 aa  208  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  55.78 
 
 		 153 aa  167  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  55.78 
 
 		 153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  54.42 
 
 		 153 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 340 aa  63.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  34.75 
 
 		 399 aa  57.4  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  34.09 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  34.09 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  52.73 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  43.28 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 324 aa  55.1  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  33.58 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  33.6 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.25 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  45 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  38.27 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  38.27 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  32.35 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  38.36 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 180 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0215  ADP-ribose pyrophosphatase  42.59 
 
 		 173 aa  51.2  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0696282  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.97 
 
 		 175 aa  50.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.97 
 
 		 175 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.97 
 
 		 175 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1550  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.979768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 218 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0861  NUDIX hydrolase  24.38 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3150  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.38 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000288941  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  26.56 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0904  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.62 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000367518  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0516  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.81 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.91 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02639  hypothetical protein  24.38 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000320087  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  27.27 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2977  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.38 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801466  hitchhiker  0.0062852 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4096  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.38 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580084  hitchhiker  0.00923204 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.97 
 
 		 193 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3032  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.38 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.33004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.38 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1132  NUDIX family hydrolase  37.35 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0573  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.08 
 
 		 203 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.454249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3671  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.81 
 
 		 226 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.38 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000193658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>