47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1308 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  100 
 
 
148 aa  294  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1274  DoxX family protein  93.92 
 
 
148 aa  275  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5591  DoxX family protein  92.52 
 
 
148 aa  269  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  91.72 
 
 
148 aa  265  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1375  DoxX family protein  80.95 
 
 
150 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1397  DoxX family protein  80.95 
 
 
150 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.995352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0915  DoxX  80.95 
 
 
150 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  75.34 
 
 
151 aa  194  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0188  hypothetical protein  61.87 
 
 
216 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0722272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5593  hypothetical protein  60.47 
 
 
141 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.421721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2393  DoxX family protein  52.63 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.563598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  45.24 
 
 
183 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5469  DoxX family protein  47.52 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.794165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4847  DoxX  46.36 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1555  DoxX family protein  43.94 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  36.64 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1669  DoxX family protein  36.59 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0195699  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  37.61 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4613  DoxX family protein  31.25 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323059  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5314  hypothetical protein  43.56 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00525142  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0761  DoxX family protein  34.4 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.750242  normal  0.361767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3971  DoxX family protein  34.06 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09540  hypothetical protein  28.03 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0893  hypothetical protein  28.03 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2696  DoxX family protein  30.08 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118642  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3506  DoxX  44.44 
 
 
72 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  33.01 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  25.44 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  31.67 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  29.7 
 
 
137 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  25.44 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  25.44 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  29.13 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  30.84 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  28.7 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  27.72 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  27.72 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  27.72 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  32.63 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  27.83 
 
 
136 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  25.22 
 
 
140 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  27.62 
 
 
149 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  26.61 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1517  DoxX family protein  26.42 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000129276  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4280  hypothetical protein  28.3 
 
 
128 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92358  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  35.14 
 
 
149 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>