More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1260 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  87.33 
 
 		 458 aa  757    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 456 aa  910    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  86.18 
 
 		 469 aa  742    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  99.12 
 
 		 456 aa  899    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  84.79 
 
 		 461 aa  756    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  84.79 
 
 		 461 aa  755    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  72.62 
 
 		 442 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  72.39 
 
 		 442 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  72.39 
 
 		 442 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  72.39 
 
 		 442 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  72.39 
 
 		 442 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  72.39 
 
 		 442 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  71.93 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  54.17 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.4 
 
 		 432 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3453  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.917862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2316  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 432 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  38.62 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  44.18 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2891  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.392127  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  34.45 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 546 aa  199  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  34.23 
 
 		 433 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  34.32 
 
 		 433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  34 
 
 		 436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  34 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  32.28 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  40.4 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  32.28 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  32.28 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  32.05 
 
 		 433 aa  193  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  32.28 
 
 		 433 aa  192  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  38.17 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 563 aa  189  7e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1936  sensor protein RstB  39.51 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.198477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1825  sensor protein RstB  39.51 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3147  sensor histidine kinase  33.04 
 
 		 478 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0895878  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  31.83 
 
 		 433 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  31.83 
 
 		 433 aa  187  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  31.83 
 
 		 433 aa  187  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  31.83 
 
 		 433 aa  187  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0551  sensor protein RstB, putative  33.82 
 
 		 429 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  36.56 
 
 		 561 aa  179  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 536 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  37.7 
 
 		 536 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  40.14 
 
 		 464 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  35.84 
 
 		 561 aa  176  6e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 535 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 535 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  35.58 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 535 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 523 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 535 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3391  histidine kinase  38.99 
 
 		 485 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0812164  normal  0.286483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  34.01 
 
 		 538 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0877  histidine kinase  35.91 
 
 		 422 aa  170  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000773434  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3185  ATPase domain-containing protein  36.75 
 
 		 422 aa  169  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00240847  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3595  sensor protein RstB, putative  34.64 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2276  sensor protein RstB  33.33 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0627622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000233737  normal  0.0772482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  33.67 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2801  sensor protein RstB, putative  36.24 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2581  sensor protein RstB  33.22 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  32.33 
 
 		 398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  34.64 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0937  sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0304  histidine kinase  32.43 
 
 		 347 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  32.23 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1103  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 422 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000605909  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  33.77 
 
 		 451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  36.74 
 
 		 408 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1031  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.53 
 
 		 431 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.286161  normal  0.755502 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 426 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 422 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 550 aa  162  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3288  histidine kinase  35.85 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000647105  normal  0.19017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1070  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  37.78 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000107691  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3678  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.227613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 422 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000859789  normal  0.518729 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5350  histidine kinase  36.19 
 
 		 376 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485302  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3170  sensor histidine kinase  29.23 
 
 		 428 aa  159  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 466 aa  159  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3430  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 376 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 376 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000179203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  35.06 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  35.06 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143276 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  35.06 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>