More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1254 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  63.69 
 
 		 513 aa  638    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  100 
 
 		 515 aa  1035    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  80 
 
 		 514 aa  799    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  98.07 
 
 		 517 aa  1009    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  78.15 
 
 		 516 aa  789    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  80 
 
 		 514 aa  799    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  90.74 
 
 		 520 aa  914    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  80.08 
 
 		 514 aa  801    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  63.71 
 
 		 514 aa  621  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  62.17 
 
 		 524 aa  607  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.29 
 
 		 512 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  57.09 
 
 		 513 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  55.34 
 
 		 512 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  55.34 
 
 		 512 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  56.48 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  57.06 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  56.94 
 
 		 512 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  53.94 
 
 		 504 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  50.71 
 
 		 499 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  52.83 
 
 		 503 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  50.71 
 
 		 499 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  54.03 
 
 		 508 aa  498  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  52.43 
 
 		 503 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  49.39 
 
 		 494 aa  488  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  52.79 
 
 		 507 aa  490  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  48.48 
 
 		 501 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  47.26 
 
 		 506 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  51.29 
 
 		 499 aa  484  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  52.24 
 
 		 495 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  50.71 
 
 		 504 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  47.47 
 
 		 497 aa  478  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 499 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  48.57 
 
 		 494 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  47.17 
 
 		 497 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  46.14 
 
 		 500 aa  472  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  46.75 
 
 		 501 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 498 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  48.48 
 
 		 503 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  47.83 
 
 		 524 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  51.13 
 
 		 508 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  48.51 
 
 		 524 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  47.83 
 
 		 524 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  45.23 
 
 		 504 aa  462  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  49.39 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  48.11 
 
 		 524 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  47.63 
 
 		 524 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  47.59 
 
 		 524 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 		 525 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.88 
 
 		 527 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 501 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  46.48 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  49.09 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  48.88 
 
 		 511 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  45.95 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  48.16 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  48.08 
 
 		 495 aa  458  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  47.29 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  46.64 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  46.53 
 
 		 515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  47.29 
 
 		 513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  48.28 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  46.14 
 
 		 496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  48.25 
 
 		 511 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  46.2 
 
 		 512 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  46.46 
 
 		 525 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  48.37 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  47.79 
 
 		 523 aa  448  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  47.23 
 
 		 505 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  46.96 
 
 		 495 aa  449  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  47.39 
 
 		 501 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  47.79 
 
 		 500 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  46.84 
 
 		 494 aa  450  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.01 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  47.19 
 
 		 501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  44.99 
 
 		 517 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  48.81 
 
 		 525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  47.36 
 
 		 497 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  47.58 
 
 		 501 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  44.74 
 
 		 496 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 494 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  45.55 
 
 		 496 aa  445  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  47.42 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  47.21 
 
 		 509 aa  443  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 		 494 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  48.07 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  47.06 
 
 		 501 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.86 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  46.06 
 
 		 500 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 		 494 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  46.86 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  45.82 
 
 		 511 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  46.86 
 
 		 501 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  47.4 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  46.86 
 
 		 501 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  48.65 
 
 		 508 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  45.97 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  46.86 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>