299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1196 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1492  polyphosphate kinase  90.23 
 
 
686 aa  1288    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.352325  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5217  polyphosphate kinase  51.24 
 
 
727 aa  684    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0214  polyphosphate kinase  56.46 
 
 
694 aa  751    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1196  polyphosphate kinase  100 
 
 
687 aa  1411    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.905186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1954  polyphosphate kinase  56.04 
 
 
714 aa  736    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1536  polyphosphate kinase  69.3 
 
 
737 aa  960    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.724834  normal  0.753907 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0581  polyphosphate kinase  90.09 
 
 
686 aa  1288    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.392428  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5250  polyphosphate kinase  50.51 
 
 
736 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0788  polyphosphate kinase  90.09 
 
 
747 aa  1288    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360404  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0367  polyphosphate kinase  48.25 
 
 
690 aa  660    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0342  polyphosphate kinase  48.25 
 
 
690 aa  661    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0293  polyphosphate kinase  50.51 
 
 
736 aa  679    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587518  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1647  polyphosphate kinase  50.88 
 
 
765 aa  669    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0834113  hitchhiker  0.000217098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  63.1 
 
 
693 aa  884    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0266  Polyphosphate kinase  52.58 
 
 
691 aa  672    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2160  polyphosphate kinase  70.18 
 
 
694 aa  983    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5842  polyphosphate kinase  59.08 
 
 
712 aa  820    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  51.24 
 
 
747 aa  684    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  62.39 
 
 
688 aa  861    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2072  polyphosphate kinase  55.14 
 
 
698 aa  683    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1626  polyphosphate kinase  90.23 
 
 
747 aa  1289    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.595101  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2388  polyphosphate kinase  54.93 
 
 
690 aa  755    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5464  polyphosphate kinase  50.36 
 
 
741 aa  681    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335851  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  51.04 
 
 
775 aa  683    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4450  polyphosphate kinase  95.63 
 
 
753 aa  1358    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.246923  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  55.67 
 
 
690 aa  744    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47440  polyphosphate kinase  51.82 
 
 
740 aa  684    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440111  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02495  polyphosphate kinase  53.81 
 
 
700 aa  670    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792775  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1876  polyphosphate kinase  51.76 
 
 
701 aa  664    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1551  Polyphosphate kinase  51.76 
 
 
701 aa  664    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.603175  hitchhiker  0.000343702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2279  polyphosphate kinase  60.29 
 
 
693 aa  843    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311481  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1891  polyphosphate kinase  52.93 
 
 
703 aa  721    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0382  polyphosphate kinase  60.38 
 
 
691 aa  841    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2766  polyphosphate kinase  89.94 
 
 
747 aa  1285    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  57.1 
 
 
693 aa  785    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2019  polyphosphate kinase  70.13 
 
 
723 aa  969    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279845  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3654  polyphosphate kinase  51.62 
 
 
702 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0555564  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  60.62 
 
 
693 aa  837    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1273  polyphosphate kinase  85.74 
 
 
687 aa  1241    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822681  normal  0.156597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2013  polyphosphate kinase  95.78 
 
 
687 aa  1360    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0590  polyphosphate kinase  51.42 
 
 
733 aa  684    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0330853  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1882  polyphosphate kinase  51.42 
 
 
762 aa  679    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2178  polyphosphate kinase  70.64 
 
 
693 aa  1000    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.539931  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1711  polyphosphate kinase  70.13 
 
 
736 aa  971    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00451534  normal  0.547143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5278  polyphosphate kinase  51.24 
 
 
747 aa  685    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0826  polyphosphate kinase  96.45 
 
 
766 aa  1062    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3999  polyphosphate kinase  52.86 
 
 
739 aa  724    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249007  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  51.24 
 
 
746 aa  686    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2161  polyphosphate kinase  55.14 
 
 
720 aa  685    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1870  polyphosphate kinase  54.6 
 
 
694 aa  699    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1278  polyphosphate kinase  96.07 
 
 
687 aa  1363    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1184  polyphosphate kinase  99.85 
 
 
687 aa  1408    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  51.53 
 
 
736 aa  699    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2306  polyphosphate kinase  50.38 
 
 
772 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1307  polyphosphate kinase  96.07 
 
 
687 aa  1363    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  51.53 
 
 
736 aa  699    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0300  polyphosphate kinase  51.53 
 
 
727 aa  689    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0822  polyphosphate kinase  55.44 
 
 
695 aa  670    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0890  polyphosphate kinase  86.9 
 
 
687 aa  1243    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570099 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0570  polyphosphate kinase  90.09 
 
 
686 aa  1288    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0676435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1523  polyphosphate kinase  90.23 
 
 
686 aa  1288    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2851  polyphosphate kinase  85.59 
 
 
687 aa  1238    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3577  polyphosphate kinase  53.23 
 
 
712 aa  663    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1299  polyphosphate kinase  90.09 
 
 
759 aa  1289    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.561572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2246  polyphosphate kinase  49.41 
 
 
703 aa  634  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3601  polyphosphate kinase  49.85 
 
 
686 aa  621  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.487429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2017  polyphosphate kinase  48.68 
 
 
700 aa  617  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  49.77 
 
 
727 aa  615  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2378  polyphosphate kinase  48.31 
 
 
723 aa  616  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1480  polyphosphate kinase  48.16 
 
 
723 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2622  polyphosphate kinase  48.46 
 
 
734 aa  608  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.494843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4920  polyphosphate kinase  47.57 
 
 
816 aa  599  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268776  normal  0.200111 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3008  polyphosphate kinase  48.98 
 
 
698 aa  596  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235985  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2212  polyphosphate kinase  48.19 
 
 
701 aa  587  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.729253  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  45.31 
 
 
722 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  45.31 
 
 
722 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1296  polyphosphate kinase  46.61 
 
 
717 aa  568  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  44.19 
 
 
721 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1035  polyphosphate kinase  45.74 
 
 
713 aa  554  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988005  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  42.78 
 
 
736 aa  548  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  44.29 
 
 
710 aa  539  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  42.84 
 
 
721 aa  540  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  41.09 
 
 
681 aa  536  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  42.86 
 
 
720 aa  536  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  40.78 
 
 
720 aa  532  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  42.79 
 
 
709 aa  531  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  44.01 
 
 
702 aa  531  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  44 
 
 
700 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  43.85 
 
 
702 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  43 
 
 
714 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  43.85 
 
 
702 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  43.85 
 
 
702 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  43.85 
 
 
702 aa  525  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  43.85 
 
 
702 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  43.63 
 
 
702 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  43.85 
 
 
702 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  43.13 
 
 
743 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  44.54 
 
 
708 aa  520  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  43.84 
 
 
760 aa  519  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  42.92 
 
 
743 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>