More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1122 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  45.01 
 
 		 780 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  48.65 
 
 		 800 aa  698    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  100 
 
 		 780 aa  1579    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  97.31 
 
 		 781 aa  1510    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  45.2 
 
 		 784 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  45.01 
 
 		 784 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  42.86 
 
 		 802 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  41.7 
 
 		 739 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  41.7 
 
 		 739 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  41.7 
 
 		 739 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  41.43 
 
 		 739 aa  567  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  40.77 
 
 		 741 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.43 
 
 		 741 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  41.43 
 
 		 741 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  41.43 
 
 		 741 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.99 
 
 		 741 aa  552  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.17 
 
 		 741 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  41.57 
 
 		 741 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.21 
 
 		 730 aa  531  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  39.62 
 
 		 740 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  39.57 
 
 		 732 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  35.76 
 
 		 780 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5359  protein-tyrosine kinase  36.33 
 
 		 800 aa  435  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  34.56 
 
 		 740 aa  412  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.74 
 
 		 736 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  34.75 
 
 		 745 aa  406  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  34.84 
 
 		 746 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  34.63 
 
 		 749 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  34.4 
 
 		 747 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  32.81 
 
 		 751 aa  375  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  31.61 
 
 		 730 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  30.45 
 
 		 746 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  31.95 
 
 		 753 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  29.99 
 
 		 721 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  32.39 
 
 		 734 aa  364  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  29.52 
 
 		 759 aa  355  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  30.16 
 
 		 735 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  31.22 
 
 		 734 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  31.94 
 
 		 747 aa  348  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  29.66 
 
 		 736 aa  348  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  29.16 
 
 		 723 aa  344  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  32.79 
 
 		 754 aa  344  4e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  29.3 
 
 		 736 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  28.92 
 
 		 716 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  29.44 
 
 		 720 aa  337  7e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  28.73 
 
 		 724 aa  336  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  29.45 
 
 		 723 aa  336  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  30.9 
 
 		 746 aa  335  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  29.58 
 
 		 720 aa  335  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  29.17 
 
 		 719 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  30.74 
 
 		 746 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  29.58 
 
 		 720 aa  334  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  30.74 
 
 		 746 aa  334  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  29.69 
 
 		 755 aa  333  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  28.77 
 
 		 720 aa  332  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  29.17 
 
 		 719 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  30.61 
 
 		 746 aa  333  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  29.17 
 
 		 719 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  29.31 
 
 		 720 aa  332  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  29.17 
 
 		 719 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  29.31 
 
 		 720 aa  331  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  29.47 
 
 		 764 aa  330  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  29.31 
 
 		 720 aa  331  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  29.17 
 
 		 720 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  29.19 
 
 		 747 aa  330  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  30.39 
 
 		 747 aa  329  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  29.04 
 
 		 720 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  28.01 
 
 		 741 aa  327  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  29.23 
 
 		 719 aa  327  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  29.26 
 
 		 746 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  29.64 
 
 		 745 aa  321  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  29.36 
 
 		 740 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  29.4 
 
 		 740 aa  320  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  28.32 
 
 		 724 aa  319  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  30.95 
 
 		 755 aa  319  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  28.74 
 
 		 727 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  28.73 
 
 		 740 aa  317  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  28.78 
 
 		 750 aa  314  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  28.99 
 
 		 748 aa  310  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  28.42 
 
 		 726 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  28.76 
 
 		 744 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  28.51 
 
 		 744 aa  308  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  27.2 
 
 		 722 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  28.95 
 
 		 744 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.67 
 
 		 726 aa  304  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.67 
 
 		 726 aa  304  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  27.67 
 
 		 726 aa  304  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.67 
 
 		 726 aa  304  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.67 
 
 		 726 aa  304  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  27.67 
 
 		 726 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.67 
 
 		 726 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  27.35 
 
 		 747 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  29.93 
 
 		 731 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.67 
 
 		 726 aa  303  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.2 
 
 		 726 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  30.05 
 
 		 764 aa  296  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  28.11 
 
 		 745 aa  286  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  27.84 
 
 		 745 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  28.51 
 
 		 745 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  29.12 
 
 		 757 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>