More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1111 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  92.46 
 
 		 399 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  100 
 
 		 399 aa  763    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  95.73 
 
 		 399 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  93.47 
 
 		 399 aa  634    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  98.99 
 
 		 399 aa  754    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  93.47 
 
 		 399 aa  634    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  93.97 
 
 		 399 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  86.22 
 
 		 398 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  85.79 
 
 		 429 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  86.22 
 
 		 398 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  86.22 
 
 		 398 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  85.79 
 
 		 429 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  85.97 
 
 		 398 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  86.22 
 
 		 398 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  77.89 
 
 		 399 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  78.52 
 
 		 404 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  87.5 
 
 		 398 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  77.63 
 
 		 400 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  51.13 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  50.4 
 
 		 395 aa  309  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  50.39 
 
 		 403 aa  309  6.999999999999999e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  52.59 
 
 		 403 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  52.03 
 
 		 415 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  52.91 
 
 		 394 aa  299  7e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  53.37 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  53.65 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  45.78 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  52.2 
 
 		 405 aa  292  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  49.44 
 
 		 389 aa  292  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  52.45 
 
 		 407 aa  292  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 403 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  50.41 
 
 		 391 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  50.7 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  52.5 
 
 		 415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  51.94 
 
 		 402 aa  279  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  52.19 
 
 		 402 aa  279  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  52.22 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  48.19 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 399 aa  272  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 399 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  44.41 
 
 		 399 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  47.46 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 385 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  44.15 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  48.94 
 
 		 396 aa  263  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  45.74 
 
 		 403 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  48.94 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  40.74 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  43.4 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  43.4 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  43.4 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  43.4 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 		 406 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 393 aa  249  7e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  42.13 
 
 		 394 aa  249  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  38.8 
 
 		 415 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  42.13 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  42.13 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  42.13 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 		 389 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  42.78 
 
 		 394 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 		 419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  42.39 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 403 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  49 
 
 		 410 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  42.9 
 
 		 399 aa  239  5e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 		 391 aa  238  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  49.57 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  49.57 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  49.57 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  41.92 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  47.51 
 
 		 405 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  40.17 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  50.29 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1580  major facilitator superfamily MFS_1  52.45 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  50.29 
 
 		 410 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  43.92 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4753  major facilitator superfamily MFS_1  51.92 
 
 		 407 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 426 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  42.96 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  43.65 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3959  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal  0.0110236 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3845  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0254807  normal  0.837631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>