More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1110 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1110  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  757    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1111  hypothetical protein  97.96 
 
 		 392 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948246  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4337  hypothetical protein  85.86 
 
 		 414 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1201  hypothetical protein  86.61 
 
 		 402 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204073  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0747  hypothetical protein  84.25 
 
 		 400 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1228  hypothetical protein  84.25 
 
 		 400 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  94.77 
 
 		 494 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  79.49 
 
 		 311 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  79.17 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  79.17 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  79.17 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  79.17 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  79.17 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  79.17 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  79.17 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.49 
 
 		 309 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  69.9 
 
 		 306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  68.77 
 
 		 309 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  38.33 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  38.67 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  38.33 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  37.92 
 
 		 296 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  37.23 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  38.58 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  38.46 
 
 		 306 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  38.46 
 
 		 306 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  38.46 
 
 		 306 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  38.46 
 
 		 306 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 		 310 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  36.49 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  36.49 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  37.74 
 
 		 306 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.02 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.02 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  33.67 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  39.07 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  34.8 
 
 		 292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  36.62 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  36.53 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  36.4 
 
 		 304 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  34.75 
 
 		 311 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  36.9 
 
 		 306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  37.15 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.97 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  36.49 
 
 		 306 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  36.49 
 
 		 306 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  36.49 
 
 		 306 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  36.49 
 
 		 306 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  36.49 
 
 		 306 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  35.71 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  33.7 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.08 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  36.96 
 
 		 304 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1580  hypothetical protein  38.37 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.38 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2864  hypothetical protein  36.05 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  35.86 
 
 		 519 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  32.27 
 
 		 326 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  25.17 
 
 		 301 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.53 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  32.45 
 
 		 312 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  32.43 
 
 		 307 aa  94  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  34.26 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 315 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  27.47 
 
 		 302 aa  87.8  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2135  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.46 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  25.83 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.89 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  25.83 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  25.83 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  25.46 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  25.65 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  25.65 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  26.04 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  28.84 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  26.64 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  29.93 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  25.29 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  24.72 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  26.22 
 
 		 303 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  26.14 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.22 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  24.71 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  26.35 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  26.35 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  26.35 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  25.63 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  22.77 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4022  hypothetical protein  28.52 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  27.92 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  22.57 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>