More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1023 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1627  excinuclease ABC subunit C  60.67 
 
 		 649 aa  830    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1023  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 684 aa  1397    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1664  excinuclease ABC subunit C  62.94 
 
 		 670 aa  818    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1932  excinuclease ABC subunit C  61.16 
 
 		 692 aa  789    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0596454 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  70.86 
 
 		 654 aa  943    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2889  excinuclease ABC subunit C  79.54 
 
 		 731 aa  1149    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0288597  normal  0.314719 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  49.34 
 
 		 603 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2244  excinuclease ABC subunit C  69.87 
 
 		 663 aa  933    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1783  excinuclease ABC subunit C  62.8 
 
 		 653 aa  827    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  51.49 
 
 		 598 aa  655    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0423  excinuclease ABC, C subunit  57.81 
 
 		 618 aa  771    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  94.3 
 
 		 677 aa  1293    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2700  excinuclease ABC subunit C  58.59 
 
 		 685 aa  790    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  53.47 
 
 		 606 aa  686    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0851  excinuclease ABC subunit C  80.03 
 
 		 740 aa  1131    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00444649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1739  excinuclease ABC subunit C  78.65 
 
 		 742 aa  1133    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00965022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  93.43 
 
 		 674 aa  1274    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2244  excinuclease ABC subunit C  61.74 
 
 		 671 aa  805    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208869  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  51.78 
 
 		 599 aa  675    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3071  excinuclease ABC subunit C  60.87 
 
 		 666 aa  826    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1095  excinuclease ABC subunit C  79.78 
 
 		 753 aa  1154    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1185  excinuclease ABC subunit C  61.53 
 
 		 657 aa  815    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2877  excinuclease ABC subunit C  61 
 
 		 650 aa  810    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.776439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  51.09 
 
 		 605 aa  641    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  70.22 
 
 		 673 aa  950    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0415  excinuclease ABC, C subunit  58.22 
 
 		 620 aa  781    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  92.59 
 
 		 681 aa  1256    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  93.88 
 
 		 682 aa  1259    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  68.41 
 
 		 657 aa  937    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1019  excinuclease ABC subunit C  99.27 
 
 		 684 aa  1388    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114773  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2623  excinuclease ABC subunit C  61.23 
 
 		 657 aa  813    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.313972  normal  0.0935336 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  92.59 
 
 		 681 aa  1256    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1960  excinuclease ABC subunit C  59.94 
 
 		 673 aa  802    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0403452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  69.66 
 
 		 657 aa  936    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2829  excinuclease ABC subunit C  86.09 
 
 		 747 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0552  excinuclease ABC subunit C  86.09 
 
 		 749 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2456  excinuclease ABC subunit C  86.09 
 
 		 747 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2884  excinuclease ABC subunit C  86.09 
 
 		 749 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2824  excinuclease ABC subunit C  86.09 
 
 		 747 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643024  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2769  excinuclease ABC subunit C  86.09 
 
 		 747 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1779  excinuclease ABC subunit C  86.09 
 
 		 747 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  47.63 
 
 		 609 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  45.89 
 
 		 611 aa  569  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  44.38 
 
 		 613 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  43.96 
 
 		 607 aa  535  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  41.51 
 
 		 599 aa  534  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  43.3 
 
 		 612 aa  532  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  45.13 
 
 		 607 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  44.74 
 
 		 607 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  42.54 
 
 		 621 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  42.69 
 
 		 627 aa  527  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3270  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 		 639 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150435  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  41.25 
 
 		 618 aa  524  1e-147  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  43.41 
 
 		 618 aa  523  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 		 609 aa  524  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  43.81 
 
 		 607 aa  522  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  43.66 
 
 		 607 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  43.89 
 
 		 607 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  42.92 
 
 		 626 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  40.8 
 
 		 618 aa  517  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  43.32 
 
 		 607 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  43.19 
 
 		 619 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  42.44 
 
 		 607 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  43.17 
 
 		 607 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  44.16 
 
 		 585 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  43.57 
 
 		 608 aa  515  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  42.02 
 
 		 610 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  42.02 
 
 		 610 aa  510  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  43.38 
 
 		 608 aa  512  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  42.17 
 
 		 610 aa  511  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  42.17 
 
 		 610 aa  510  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  41.58 
 
 		 610 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  43.26 
 
 		 614 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  42.17 
 
 		 610 aa  511  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  42.17 
 
 		 610 aa  511  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  41.59 
 
 		 608 aa  508  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  41.87 
 
 		 610 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  43.92 
 
 		 614 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  41.87 
 
 		 617 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  42.02 
 
 		 610 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  43.77 
 
 		 645 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  41.43 
 
 		 610 aa  508  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  41.87 
 
 		 617 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  40.7 
 
 		 609 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  41.58 
 
 		 610 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  41.73 
 
 		 610 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2449  excinuclease ABC subunit C  40.82 
 
 		 608 aa  502  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0823614  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  41.73 
 
 		 610 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  41.73 
 
 		 610 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  41.73 
 
 		 610 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  40.56 
 
 		 610 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  41.73 
 
 		 607 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1825  excinuclease ABC subunit C  41.79 
 
 		 609 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.088783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  42.63 
 
 		 657 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  42.17 
 
 		 588 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  39.91 
 
 		 613 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0205  excinuclease ABC subunit C  42.84 
 
 		 614 aa  495  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0351181  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  41.21 
 
 		 609 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  40.52 
 
 		 609 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003099  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 		 588 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000908036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>