267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0962 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  100 
 
 
166 aa  337  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  98.8 
 
 
195 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  94.55 
 
 
209 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  93.98 
 
 
166 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  93.37 
 
 
166 aa  300  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  93.37 
 
 
186 aa  298  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  93.33 
 
 
166 aa  295  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  87.88 
 
 
219 aa  295  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  87.88 
 
 
167 aa  295  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  87.88 
 
 
167 aa  295  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  87.88 
 
 
167 aa  295  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  87.88 
 
 
167 aa  295  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  87.88 
 
 
167 aa  295  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  87.27 
 
 
167 aa  293  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  87.27 
 
 
167 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  86.5 
 
 
166 aa  286  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  78.66 
 
 
166 aa  268  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  77.44 
 
 
166 aa  265  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  73.01 
 
 
167 aa  241  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  74.23 
 
 
167 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  72.39 
 
 
167 aa  237  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  66.87 
 
 
166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  66.26 
 
 
166 aa  207  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  55.56 
 
 
162 aa  173  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  50.9 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  54.55 
 
 
169 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  50.62 
 
 
163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  50.93 
 
 
165 aa  164  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  50 
 
 
169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  49.09 
 
 
171 aa  162  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  50 
 
 
162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 
167 aa  160  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  53.94 
 
 
259 aa  160  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.935978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  46.91 
 
 
162 aa  157  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  48.75 
 
 
159 aa  157  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  54.04 
 
 
164 aa  157  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
162 aa  157  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  52.44 
 
 
171 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  43.75 
 
 
161 aa  156  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
162 aa  156  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 
163 aa  156  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  52.15 
 
 
164 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
162 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
162 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
162 aa  155  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
162 aa  155  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
162 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
162 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
162 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
162 aa  154  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 
195 aa  154  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 
178 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  46.67 
 
 
172 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  48.75 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  50.61 
 
 
164 aa  154  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  48.47 
 
 
177 aa  154  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 
167 aa  153  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  52.45 
 
 
162 aa  152  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  44.44 
 
 
161 aa  153  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 
179 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
176 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  41.36 
 
 
162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 
166 aa  150  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 
160 aa  150  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 
160 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 
164 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 
160 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
172 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 
164 aa  148  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  50.61 
 
 
167 aa  148  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  50.61 
 
 
167 aa  148  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 
164 aa  148  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  45 
 
 
161 aa  147  4e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  47.24 
 
 
164 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  45 
 
 
161 aa  147  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 
160 aa  147  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  53.01 
 
 
165 aa  147  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 
174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  42.94 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 
172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  49.07 
 
 
177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  45.96 
 
 
163 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2773  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 
166 aa  145  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0219199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  45.24 
 
 
187 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 
160 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 
162 aa  144  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 
161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 
160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  44.25 
 
 
173 aa  143  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
170 aa  143  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 
171 aa  143  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 
166 aa  143  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
170 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
170 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  47.74 
 
 
180 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 
172 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  46.47 
 
 
170 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>