187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0773 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
396 aa  802    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  85.61 
 
 
422 aa  685    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  28.72 
 
 
396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  32.67 
 
 
399 aa  156  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
417 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
417 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
397 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
404 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 
402 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
404 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  29.55 
 
 
399 aa  132  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.05 
 
 
413 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 
407 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 
401 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
399 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
402 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  28.02 
 
 
413 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
410 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
436 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
434 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.75 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
402 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
274 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  30.13 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
456 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
376 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
387 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
435 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
416 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  25.38 
 
 
414 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
399 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
399 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
409 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
421 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
405 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
410 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
418 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
1340 aa  100  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
994 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
405 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
956 aa  96.3  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
410 aa  94.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
400 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 
406 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
360 aa  93.2  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  26.49 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
1156 aa  90.5  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
411 aa  90.5  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
405 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
396 aa  89.7  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  22.06 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  27.16 
 
 
402 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  29.12 
 
 
408 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
703 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 
371 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  31.08 
 
 
443 aa  87.4  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.68 
 
 
700 aa  87.4  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
443 aa  87  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  21.8 
 
 
397 aa  86.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  27.1 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  24.82 
 
 
1119 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  26.42 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
499 aa  83.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  24.91 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  32.89 
 
 
860 aa  80.5  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  26.3 
 
 
442 aa  79  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  25.61 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  21.11 
 
 
394 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  26.26 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  23.87 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
1106 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2185  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  21.43 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  24.48 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
535 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  26.48 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  24.54 
 
 
420 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>