More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0769 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  46.39 
 
 
1398 aa  1077    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
1241 aa  2550    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  44.51 
 
 
1089 aa  856    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  42.94 
 
 
1229 aa  936    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  83.24 
 
 
1241 aa  2141    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  49.56 
 
 
1261 aa  1188    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  47.49 
 
 
1028 aa  891    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  45.58 
 
 
1243 aa  1026    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  48.07 
 
 
1915 aa  1134    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  49.67 
 
 
609 aa  594  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  46.79 
 
 
1332 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  38.34 
 
 
831 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  43.32 
 
 
838 aa  331  4e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  28.55 
 
 
743 aa  313  1e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  45.29 
 
 
1635 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.58 
 
 
815 aa  305  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  42.48 
 
 
850 aa  302  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  37.84 
 
 
846 aa  298  5e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  42.44 
 
 
846 aa  296  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  43.04 
 
 
431 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
860 aa  268  4e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  34.89 
 
 
859 aa  265  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  33.91 
 
 
1219 aa  246  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  32.62 
 
 
1232 aa  227  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  36.34 
 
 
967 aa  218  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  35.78 
 
 
460 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  35.46 
 
 
460 aa  174  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  39.91 
 
 
386 aa  161  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  36.01 
 
 
455 aa  160  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
395 aa  156  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
394 aa  154  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1212  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
451 aa  153  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360145  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  37.69 
 
 
371 aa  152  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  36.8 
 
 
376 aa  152  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
382 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
374 aa  140  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  33.96 
 
 
351 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 
382 aa  139  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 
370 aa  138  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
370 aa  138  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2369  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
770 aa  137  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87241  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
435 aa  137  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0218  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
480 aa  137  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031233  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  32.84 
 
 
381 aa  137  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  34.39 
 
 
417 aa  135  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
378 aa  135  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  31.14 
 
 
381 aa  135  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
374 aa  134  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
400 aa  133  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
381 aa  132  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
370 aa  131  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  34.42 
 
 
380 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 
382 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
384 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  30.45 
 
 
381 aa  130  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 
482 aa  129  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 
390 aa  129  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
394 aa  128  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.77 
 
 
384 aa  128  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.99 
 
 
385 aa  128  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
373 aa  127  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
381 aa  127  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
377 aa  127  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 
393 aa  126  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
360 aa  125  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 
397 aa  125  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
434 aa  125  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
420 aa  125  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0106  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
469 aa  124  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.341014  normal  0.913948 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  25.74 
 
 
375 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
375 aa  124  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  36.26 
 
 
389 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
408 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.74 
 
 
375 aa  124  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
431 aa  124  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  33.21 
 
 
346 aa  122  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
346 aa  122  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
366 aa  122  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
373 aa  122  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
366 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
384 aa  122  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
361 aa  121  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
444 aa  121  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
357 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
381 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
387 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
387 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
378 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1975  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
763 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.422047  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 
361 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
390 aa  119  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 
384 aa  118  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
382 aa  118  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 
395 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
437 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
380 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
380 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
382 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  29.6 
 
 
364 aa  116  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
393 aa  116  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>