More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0767 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  100 
 
 
406 aa  833    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  71.29 
 
 
406 aa  597  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  65.58 
 
 
421 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  64.82 
 
 
421 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  65.33 
 
 
416 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  57.07 
 
 
405 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  56.3 
 
 
405 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  53.55 
 
 
410 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  53.77 
 
 
402 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2170  putative ABC transporter  41.61 
 
 
431 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  42.2 
 
 
432 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  42.03 
 
 
443 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  43.65 
 
 
438 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  38.53 
 
 
472 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  37.8 
 
 
464 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  38.29 
 
 
410 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  37.92 
 
 
448 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  37.05 
 
 
456 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  36.73 
 
 
436 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  36.56 
 
 
455 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  33.83 
 
 
394 aa  256  4e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  41.1 
 
 
416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  39.23 
 
 
450 aa  253  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  39.75 
 
 
870 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 
440 aa  252  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  37.56 
 
 
711 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  37.53 
 
 
429 aa  249  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  36.21 
 
 
437 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  39.45 
 
 
416 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  36.47 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  39.24 
 
 
409 aa  243  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  38.67 
 
 
429 aa  243  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.89 
 
 
454 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  32.95 
 
 
449 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  39.59 
 
 
447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  36.95 
 
 
472 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  44.15 
 
 
424 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  38.3 
 
 
407 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  35.34 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  36.95 
 
 
424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  35.7 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  46 
 
 
472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  39.53 
 
 
408 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  38.06 
 
 
488 aa  234  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  48.57 
 
 
468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  46.04 
 
 
493 aa  232  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  35.25 
 
 
416 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 
469 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  43.1 
 
 
412 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
465 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
469 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
465 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
465 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
465 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
465 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
471 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  48.31 
 
 
424 aa  225  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  39.15 
 
 
816 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  36.02 
 
 
415 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  33.42 
 
 
425 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 
393 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 
393 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.88 
 
 
415 aa  219  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  35.37 
 
 
478 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  47.64 
 
 
254 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  35.19 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  36.21 
 
 
424 aa  216  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  45.85 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0594  ABC transporter related  44.31 
 
 
260 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  40.61 
 
 
418 aa  213  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  39.66 
 
 
594 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  36.2 
 
 
427 aa  210  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  44.02 
 
 
242 aa  210  4e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  40.48 
 
 
422 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  40.61 
 
 
428 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  33.99 
 
 
418 aa  209  8e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  38.51 
 
 
428 aa  208  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  41.34 
 
 
418 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  45.92 
 
 
498 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  38.29 
 
 
411 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  41.16 
 
 
390 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  39.62 
 
 
433 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  36.76 
 
 
429 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 
422 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  36.9 
 
 
411 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  40.79 
 
 
390 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2181  ABC transporter, ATPase subunit  41.92 
 
 
396 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  42.08 
 
 
369 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  49.49 
 
 
649 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  38.48 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  33.88 
 
 
431 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  39.44 
 
 
420 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  48.48 
 
 
427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  42.68 
 
 
392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  41.25 
 
 
254 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  46.7 
 
 
429 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  37.42 
 
 
422 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  42.74 
 
 
421 aa  199  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  50 
 
 
427 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  40.85 
 
 
247 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>