More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0653 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  86.32 
 
 		 402 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  86.32 
 
 		 402 aa  728    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  86.32 
 
 		 402 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  94.03 
 
 		 402 aa  787    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  87.06 
 
 		 402 aa  735    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  86.72 
 
 		 399 aa  725    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  94.78 
 
 		 402 aa  794    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 		 402 aa  828    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  94.28 
 
 		 402 aa  791    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  86.32 
 
 		 402 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  99.25 
 
 		 402 aa  822    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  94.53 
 
 		 402 aa  793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  86.57 
 
 		 402 aa  731    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  92.04 
 
 		 402 aa  773    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  86.32 
 
 		 402 aa  728    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  52.5 
 
 		 426 aa  423  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  52.43 
 
 		 403 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  51.92 
 
 		 403 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  49.12 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  47.15 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  46.7 
 
 		 397 aa  348  8e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  46.94 
 
 		 410 aa  348  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  46.7 
 
 		 397 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  47.06 
 
 		 397 aa  345  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  46.45 
 
 		 397 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  46.7 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  47.21 
 
 		 397 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  46.95 
 
 		 397 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  46.53 
 
 		 393 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  47.37 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  46.87 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  47.01 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  47.97 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  47.97 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  47.97 
 
 		 402 aa  324  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  47.97 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  47.97 
 
 		 402 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  47.72 
 
 		 402 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  47.72 
 
 		 402 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07160  response to stress-related protein, putative  43.13 
 
 		 504 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  43.36 
 
 		 396 aa  319  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  43.46 
 
 		 400 aa  319  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  46.94 
 
 		 393 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  47.57 
 
 		 411 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  44.83 
 
 		 392 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  45.43 
 
 		 411 aa  315  9e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  44.58 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  43.43 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  43.43 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.4 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  42.89 
 
 		 396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  44.58 
 
 		 392 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  44.42 
 
 		 414 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  41.85 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4378  nitric oxide dioxygenase  43.84 
 
 		 392 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  42.39 
 
 		 396 aa  309  5e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.74 
 
 		 393 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  46.63 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  44.09 
 
 		 393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.95 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  46.7 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  41.88 
 
 		 396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  43.84 
 
 		 393 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0969  nitric oxide dioxygenase  45.91 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.137694  normal  0.0138657 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.67 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.77 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  45.07 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  45.66 
 
 		 414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.252799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  44.03 
 
 		 413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  43.1 
 
 		 409 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  45.41 
 
 		 414 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  44.99 
 
 		 393 aa  301  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3408  nitric oxide dioxygenase  44.69 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.69 
 
 		 406 aa  298  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1079  nitric oxide dioxygenase  44.75 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1895  nitric oxide dioxygenase  45.83 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00231107  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  40.92 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  41.1 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.1 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  45.94 
 
 		 401 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  41.1 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  43.75 
 
 		 395 aa  291  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4652  nitric oxide dioxygenase  42.61 
 
 		 393 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  41.1 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  43.21 
 
 		 429 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  41.1 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  41.1 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0909  nitric oxide dioxygenase  43.92 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357631  normal  0.205289 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  44.44 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  41.1 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  41.1 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  41.1 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  40.85 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  40.85 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  40.6 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  40.66 
 
 		 394 aa  289  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1514  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.45 
 
 		 402 aa  289  8e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.156255 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  41.67 
 
 		 393 aa  288  9e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.89 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.89 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>