More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0636 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
107 aa  215  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
107 aa  215  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
107 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
107 aa  215  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
107 aa  215  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
107 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  99.07 
 
 
107 aa  214  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  90.83 
 
 
109 aa  197  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  87.16 
 
 
109 aa  190  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  87.85 
 
 
120 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  92.59 
 
 
108 aa  182  1e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  92.59 
 
 
108 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  92.59 
 
 
108 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  92.59 
 
 
108 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  92.59 
 
 
108 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  92.59 
 
 
108 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  92.59 
 
 
108 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  92.59 
 
 
108 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  71.03 
 
 
108 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  71.96 
 
 
108 aa  147  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  70 
 
 
110 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  70 
 
 
110 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  76.4 
 
 
109 aa  144  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  66.98 
 
 
108 aa  140  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  66.29 
 
 
91 aa  134  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  64.13 
 
 
108 aa  133  1e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  60.19 
 
 
108 aa  132  2e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  65.22 
 
 
109 aa  130  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  65.22 
 
 
110 aa  130  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  63.33 
 
 
91 aa  130  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  64.15 
 
 
108 aa  127  7e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  65.17 
 
 
127 aa  127  7e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  62.22 
 
 
92 aa  124  4e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  58.06 
 
 
111 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  58.89 
 
 
93 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  61.36 
 
 
94 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  62.22 
 
 
106 aa  120  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  58.43 
 
 
108 aa  116  1e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  56.18 
 
 
91 aa  112  2e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  53.49 
 
 
113 aa  111  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  48.08 
 
 
168 aa  111  4e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  50.91 
 
 
110 aa  110  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 
108 aa  110  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  8.08918e-08  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  56.32 
 
 
106 aa  110  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  58.33 
 
 
117 aa  107  4e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 
110 aa  107  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  46.73 
 
 
110 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  46.73 
 
 
110 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  46.73 
 
 
110 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  46.73 
 
 
110 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  1.05955e-06 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  46.73 
 
 
110 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  46.73 
 
 
110 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  46.73 
 
 
110 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  47.83 
 
 
111 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  46.73 
 
 
110 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  46.73 
 
 
110 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  46.73 
 
 
110 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  47.83 
 
 
111 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  46.73 
 
 
110 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  46.73 
 
 
110 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  46.73 
 
 
110 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  45.71 
 
 
109 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  45.79 
 
 
110 aa  103  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
109 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  45.19 
 
 
111 aa  103  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  44.95 
 
 
110 aa  103  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  53.41 
 
 
111 aa  103  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  53.41 
 
 
111 aa  103  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  45.19 
 
 
123 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  50.57 
 
 
109 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  61.84 
 
 
110 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 
114 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  45.95 
 
 
110 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 
110 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  46.85 
 
 
120 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  45.79 
 
 
110 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004366  preprotein translocase subunit YajC  56.63 
 
 
109 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01346  preprotein translocase subunit YajC  49.55 
 
 
112 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153767  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  47.22 
 
 
110 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  44.34 
 
 
109 aa  100  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.98451e-12  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  54.55 
 
 
116 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  8.75528e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01047  preprotein translocase subunit YajC  55.42 
 
 
109 aa  100  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  54.55 
 
 
116 aa  100  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.00527e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  44.25 
 
 
110 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1179  preprotein translocase subunit, YajC  42.59 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  3.13492e-06  hitchhiker  7.20992e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.18136e-08  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
110 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  48.15 
 
 
111 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.98712e-08  hitchhiker  6.23922e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 
110 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.29003e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  49.5 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.42137e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  4.16487e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3290  preprotein translocase subunit YajC  45.28 
 
 
109 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  53.75 
 
 
112 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  53.75 
 
 
112 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>