84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0625 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  96.69 
 
 
242 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  86.61 
 
 
239 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  85.36 
 
 
238 aa  360  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  84.52 
 
 
238 aa  355  3e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  84.17 
 
 
240 aa  352  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  86.11 
 
 
243 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  75.15 
 
 
239 aa  242  4e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  75.15 
 
 
256 aa  242  4e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  75.15 
 
 
256 aa  242  4e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  75.15 
 
 
256 aa  242  4e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  75.15 
 
 
252 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  75.15 
 
 
252 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  74.55 
 
 
252 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  72.62 
 
 
264 aa  239  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  57.53 
 
 
233 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  64.41 
 
 
233 aa  205  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  61.4 
 
 
248 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  55.76 
 
 
250 aa  196  4e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  44.39 
 
 
253 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  46.37 
 
 
233 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  45.5 
 
 
236 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.07973e-05  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  43.01 
 
 
208 aa  129  4e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  37.76 
 
 
201 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  37.75 
 
 
207 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  38.22 
 
 
196 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  37.13 
 
 
210 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  35.96 
 
 
211 aa  98.6  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  37.71 
 
 
195 aa  98.2  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  31.58 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  34.41 
 
 
188 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  38.29 
 
 
192 aa  96.3  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  31.98 
 
 
207 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  33.18 
 
 
222 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  34.97 
 
 
191 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  32.71 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  34.22 
 
 
199 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  34.69 
 
 
215 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  35.71 
 
 
176 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  34.46 
 
 
176 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  28.72 
 
 
212 aa  84.7  1e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  32.24 
 
 
183 aa  83.2  3e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  34.48 
 
 
197 aa  81.6  9e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.2506e-07 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  30.57 
 
 
204 aa  79.7  4e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  34.48 
 
 
196 aa  77  2e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  34.3 
 
 
178 aa  68.6  8e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  27.14 
 
 
225 aa  64.7  1e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  28.93 
 
 
203 aa  63.9  2e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  28.04 
 
 
209 aa  62  8e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  29.69 
 
 
201 aa  61.6  1e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  34.38 
 
 
202 aa  59.7  5e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  34.78 
 
 
206 aa  58.9  6e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  28.93 
 
 
197 aa  55.5  7e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  35 
 
 
200 aa  51.6  1e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  28.22 
 
 
182 aa  50.4  2e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  28.22 
 
 
182 aa  50.4  2e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  27.88 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.57242e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  32.12 
 
 
232 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.67749e-09 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  25.37 
 
 
211 aa  46.2  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  24.6 
 
 
195 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  26.84 
 
 
186 aa  45.4  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  27.87 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.61465e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  27.87 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.2581e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3500  hypothetical protein  28.72 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  27.81 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  27.81 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  26.78 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.82452e-07  normal  0.394753 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  27.87 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.76204e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  27.87 
 
 
187 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.27636e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  26.67 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  27.87 
 
 
187 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.40203e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  24.72 
 
 
198 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  27.87 
 
 
187 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.85697e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  31.11 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  27.87 
 
 
187 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  27.87 
 
 
187 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.51515e-06  hitchhiker  2.97897e-06 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  27.81 
 
 
192 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  27.44 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  26.38 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  26.38 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  23.74 
 
 
211 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  26.38 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  26.38 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.48477e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  26.38 
 
 
187 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>