129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0525 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0501  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 157 aa  298  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.354763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0525  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 157 aa  298  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0116  17 kDa surface antigen  98.73 
 
 		 157 aa  293  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0599  17 kDa surface antigen  98.73 
 
 		 157 aa  293  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0568  17 kDa surface antigen  98.73 
 
 		 157 aa  293  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  decreased coverage  0.000059328 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3682  outer membrane lipoprotein  96.82 
 
 		 157 aa  265  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2785  17 kDa surface antigen  92.99 
 
 		 157 aa  226  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245544  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2507  outer membrane lipoprotein  89.81 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3507  outer membrane lipoprotein  89.81 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1157  outer membrane lipoprotein  89.81 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0428  outer membrane lipoprotein  89.81 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1287  outer membrane lipoprotein  89.81 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3471  outer membrane lipoprotein  89.81 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.31165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3509  outer membrane lipoprotein  89.81 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3277  outer membrane lipoprotein  89.81 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3432  17 kDa surface antigen  65.82 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0130273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0526  putative outer membrane lipoprotein, SlyB-like  58.86 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2635  17 kDa surface antigen  59.21 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  53.16 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  55.1 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3037  17 kDa surface antigen  52.7 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2627  17 kDa surface antigen  52.03 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.940371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  47.13 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  47.52 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000215158  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3070  17 kDa surface antigen  50 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.612829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1167  17 kDa surface antigen  46.5 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1131  17 kDa surface antigen  45.86 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4284  17 kDa surface antigen  45.86 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3852  lipoprotein SlyB, putative  46.5 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50740  hypothetical protein  43.95 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4325  hypothetical protein  43.95 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1231  surface antigen protein  45.22 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  45.24 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19520  outer membrane lipoprotein  42.68 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  39.1 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0208  surface antigen protein  46.15 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4115  lipoprotein SlyB, putative  44.59 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.404382  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1898  outer membrane lipoprotein pcp  38 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1555  outer membrane lipoprotein pcp  38 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.949838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1807  17 kDa surface antigen  40.44 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55882  hitchhiker  0.000926812 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1542  outer membrane lipoprotein pcp  38 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1615  outer membrane lipoprotein pcp  38 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1729  outer membrane lipoprotein pcp  38 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0331047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  40.28 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2558  outer membrane lipoprotein Pcp  36.67 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000494181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1877  17 kDa surface antigen  36.67 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000817006  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1440  17 kDa surface antigen  43.87 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.390363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1769  outer membrane lipoprotein Pcp  37.06 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000141648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01611  outer membrane lipoprotein  37.78 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1999  17 kDa surface antigen  37.78 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00005432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01601  hypothetical protein  37.78 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2353  outer membrane lipoprotein SlyB  37.78 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00612536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1717  outer membrane lipoprotein SlyB  37.78 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.535204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1851  outer membrane lipoprotein SlyB  37.78 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1988  17 kDa surface antigen  37.78 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.636223  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1558  outer membrane lipoprotein SlyB  37.78 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1833  outer membrane lipoprotein SlyB  37.78 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.520508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1723  17 kDa surface antigen  41.48 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00134301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0915  17 kDa surface antigen  43.51 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.852143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0037  17 kDa surface antigen  46.04 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0170  outer membrane lipoprotein, putative  49.64 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0832777 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6233  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  35.03 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0997303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2665  17 kDa surface antigen  42.22 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2381  17 kDa surface antigen  42.22 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00375113  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1690  17 kDa surface antigen  42.14 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003797  putative outer membrane lipoprotein Pcp  37.42 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2965  17 kDa surface antigen  40.67 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.879461 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0378  outer membrane lipoprotein PcP  36.24 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1219  outer membrane lipoprotein PcP  36.24 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1150  Outer membrane lipoprotein-like  45.32 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527599  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  36.21 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  26.42 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0804  17 kDa surface antigen  42.52 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0445  17 kDa surface antigen  35.57 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  40.57 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  27.67 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  41.35 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  31.01 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  36.63 
 
 		 225 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  32.28 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  32.28 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  32.28 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  32.28 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  32.28 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  32.28 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2606  15 kDa peptidoglycan-associated lipoprotein  32.48 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2888  15 kDa peptidoglycan-associated lipoprotein  32.48 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  32.28 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  31.85 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  31.78 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2931  17 kDa surface antigen  43.48 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.897398  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  33.96 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5596  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  33.83 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  34.62 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  33.96 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  33.96 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  33.96 
 
 		 216 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  38.1 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  34.91 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  36.61 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>