More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0469 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  79.17 
 
 		 434 aa  694    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2875  phenylacetyl-CoA-ligase protein  78.89 
 
 		 436 aa  692    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0228707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539  phenylacetate-coenzyme A ligase  91.42 
 
 		 432 aa  784    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0321632  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  95.6 
 
 		 432 aa  847    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  79.72 
 
 		 434 aa  715    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  72.49 
 
 		 448 aa  643    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  91.42 
 
 		 432 aa  786    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  96.76 
 
 		 432 aa  860    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0935  phenylacetate-coenzyme A ligase  91.42 
 
 		 432 aa  784    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1905  phenylacetate-coenzyme A ligase  91.42 
 
 		 432 aa  784    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  90.49 
 
 		 432 aa  791    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  78.42 
 
 		 434 aa  687    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  90.49 
 
 		 434 aa  806    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  91.65 
 
 		 434 aa  821    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  78.55 
 
 		 434 aa  702    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  96.98 
 
 		 432 aa  855    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  91.65 
 
 		 432 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  99.07 
 
 		 432 aa  876    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  96.98 
 
 		 432 aa  855    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 432 aa  882    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  96.99 
 
 		 432 aa  858    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  90.95 
 
 		 434 aa  819    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3550  phenylacetate-CoA ligase  91.65 
 
 		 432 aa  788    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0638  phenylacetate-CoA ligase  91.42 
 
 		 432 aa  784    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100652  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  71.5 
 
 		 434 aa  628  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  69.65 
 
 		 439 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  70.12 
 
 		 439 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  69.65 
 
 		 439 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  69.3 
 
 		 431 aa  620  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  70.14 
 
 		 440 aa  618  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  70.73 
 
 		 440 aa  618  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  69.46 
 
 		 439 aa  614  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  70.14 
 
 		 440 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  69.91 
 
 		 440 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  69.41 
 
 		 439 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  71.5 
 
 		 435 aa  614  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  70.3 
 
 		 440 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  70.37 
 
 		 440 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  70.3 
 
 		 440 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  70.56 
 
 		 436 aa  617  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  70.05 
 
 		 436 aa  617  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  68.54 
 
 		 436 aa  609  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  69.86 
 
 		 436 aa  606  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  68.87 
 
 		 433 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  67.76 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  66.59 
 
 		 441 aa  597  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  64.57 
 
 		 439 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  66.82 
 
 		 436 aa  591  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  67.37 
 
 		 441 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  66.74 
 
 		 444 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  68.85 
 
 		 450 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0374  phenylacetate-CoA ligase  65.51 
 
 		 441 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000302001  hitchhiker  0.00000497277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  68.09 
 
 		 434 aa  589  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3944  phenylacetate-CoA ligase  67.9 
 
 		 439 aa  590  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  67.83 
 
 		 449 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  64.91 
 
 		 437 aa  586  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  64.68 
 
 		 437 aa  585  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  64.91 
 
 		 437 aa  586  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  64.68 
 
 		 437 aa  585  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1923  phenylacetate-CoA ligase  66.82 
 
 		 443 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0702505  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  64.27 
 
 		 431 aa  585  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  65.65 
 
 		 436 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  68.53 
 
 		 438 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  67.37 
 
 		 443 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  66.35 
 
 		 444 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2870  phenylacetate-CoA ligase  65.73 
 
 		 442 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  66.43 
 
 		 448 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1829  phenylacetate-CoA ligase  65.88 
 
 		 444 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.914606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  66.43 
 
 		 445 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  66.35 
 
 		 446 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  65.34 
 
 		 439 aa  568  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1449  phenylacetate-CoA ligase  67.7 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6182  phenylacetate-CoA ligase  64.86 
 
 		 435 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2034  phenylacetate-CoA ligase  65.88 
 
 		 437 aa  551  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0477  phenylacetate-CoA ligase  65.17 
 
 		 427 aa  537  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3048  phenylacetate-CoA ligase  60.75 
 
 		 456 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3247  phenylacetate-CoA ligase  61.08 
 
 		 444 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20330  phenylacetate-CoA ligase  58.73 
 
 		 449 aa  510  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  57.88 
 
 		 444 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  57.18 
 
 		 444 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  58.49 
 
 		 446 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  55.16 
 
 		 433 aa  485  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  56.47 
 
 		 434 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  56.94 
 
 		 444 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  55.06 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  52.57 
 
 		 435 aa  471  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  54.82 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  56.05 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  51.64 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  52.46 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  54.35 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  52.79 
 
 		 435 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  54.12 
 
 		 435 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  52.34 
 
 		 434 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  53.04 
 
 		 432 aa  463  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  51.87 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  54.01 
 
 		 435 aa  463  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  52.57 
 
 		 432 aa  461  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  53.04 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  53.88 
 
 		 433 aa  464  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>