53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0426 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0426  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  320  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.63413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  96.95 
 
 		 164 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3583  hypothetical protein  90.24 
 
 		 183 aa  275  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  89.63 
 
 		 164 aa  273  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  89.63 
 
 		 164 aa  273  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0467  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  89.63 
 
 		 164 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  84.66 
 
 		 180 aa  251  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1729  putative lipoprotein  67.38 
 
 		 167 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0037  putative lipoprotein  67.38 
 
 		 167 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3609  putative lipoprotein  67.38 
 
 		 167 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3634  putative lipoprotein  67.38 
 
 		 167 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3163  putative lipoprotein  67.38 
 
 		 167 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3621  putative lipoprotein  67.38 
 
 		 167 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2815  hypothetical protein  67.38 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  62.42 
 
 		 163 aa  184  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2944  hypothetical protein  66.42 
 
 		 198 aa  180  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  59.06 
 
 		 196 aa  178  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  55.41 
 
 		 167 aa  174  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2272  putative lipoprotein  56.33 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000762605  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  58.52 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  59.09 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1815  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  52 
 
 		 160 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0854923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  52.74 
 
 		 159 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2191  putative lipoprotein  52.83 
 
 		 159 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2572  putative lipoprotein  54.55 
 
 		 176 aa  153  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  55.38 
 
 		 157 aa  151  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  58.27 
 
 		 158 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  53.08 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0086  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  58.65 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  53.08 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3428  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  54.55 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.765772  normal  0.866468 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0226  hypothetical protein  47.1 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3555  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  49.21 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.113514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  38.64 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  36.36 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  40.45 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  31.01 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1043  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  32.31 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.402135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  30.88 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  32.35 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  30.6 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  26.39 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  28.45 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  28.15 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  27.54 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  32.69 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  31.73 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  26.76 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  26.76 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  31.71 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  26.72 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  27.68 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4130  hypothetical protein  23.94 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>