175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0406 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  63.74 
 
 		 616 aa  793    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  84.48 
 
 		 612 aa  1078    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  56.05 
 
 		 610 aa  707    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  79.08 
 
 		 612 aa  1007    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  96.24 
 
 		 611 aa  1210    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  98.85 
 
 		 611 aa  1239    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  79.9 
 
 		 612 aa  1007    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  98.69 
 
 		 611 aa  1232    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  99.67 
 
 		 611 aa  1246    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  98.69 
 
 		 611 aa  1232    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  100 
 
 		 611 aa  1248    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  58.4 
 
 		 611 aa  734    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  78.92 
 
 		 612 aa  1006    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  78.92 
 
 		 612 aa  1006    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  78.92 
 
 		 612 aa  1003    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  79.08 
 
 		 612 aa  1007    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  98.69 
 
 		 611 aa  1232    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  46.53 
 
 		 660 aa  529  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0628  hypothetical protein  46.88 
 
 		 646 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  45.57 
 
 		 616 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1762  hypothetical protein  45.57 
 
 		 633 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1373  hypothetical protein  45.57 
 
 		 616 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0502  hypothetical protein  45.57 
 
 		 616 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1575  hypothetical protein  45.73 
 
 		 616 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  45.73 
 
 		 633 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0951  hypothetical protein  47.12 
 
 		 605 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0777  hypothetical protein  47.12 
 
 		 605 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0789  hypothetical protein  47.12 
 
 		 605 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6433  type VI secretion protein  44.79 
 
 		 603 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7618  hypothetical protein  43.39 
 
 		 620 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1190  hypothetical protein  42.06 
 
 		 626 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  41.67 
 
 		 611 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1289  type VI secretion protein  42.67 
 
 		 603 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  39.71 
 
 		 610 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  39.45 
 
 		 606 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  39.38 
 
 		 606 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  39.12 
 
 		 606 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  39.45 
 
 		 606 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  37.82 
 
 		 590 aa  360  3e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.66 
 
 		 590 aa  349  9e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  36.25 
 
 		 605 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  35.36 
 
 		 589 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.62 
 
 		 623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  35.25 
 
 		 589 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  34.36 
 
 		 586 aa  302  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  37.38 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  36.26 
 
 		 597 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  36.75 
 
 		 597 aa  300  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  33.17 
 
 		 609 aa  298  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  34.19 
 
 		 619 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  34.19 
 
 		 619 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  33.39 
 
 		 625 aa  291  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  34.13 
 
 		 619 aa  291  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  33.82 
 
 		 623 aa  286  8e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  33.82 
 
 		 623 aa  286  8e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  33.82 
 
 		 623 aa  286  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  33.82 
 
 		 623 aa  286  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  33.82 
 
 		 623 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  33.82 
 
 		 623 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  32.45 
 
 		 628 aa  283  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  33.82 
 
 		 623 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  33.5 
 
 		 623 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  33.44 
 
 		 629 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  33.28 
 
 		 592 aa  274  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.39 
 
 		 630 aa  273  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  32.08 
 
 		 623 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.17 
 
 		 624 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  32.84 
 
 		 582 aa  270  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  34.14 
 
 		 593 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  32.17 
 
 		 630 aa  266  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  32.39 
 
 		 629 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  32.65 
 
 		 629 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  32.46 
 
 		 590 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  32.39 
 
 		 582 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  30.93 
 
 		 607 aa  260  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.01 
 
 		 629 aa  259  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.76 
 
 		 626 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  31.26 
 
 		 588 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  30.74 
 
 		 588 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  31.08 
 
 		 629 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  30.4 
 
 		 588 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  29.79 
 
 		 627 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  33.72 
 
 		 587 aa  247  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  31.44 
 
 		 629 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  31.44 
 
 		 629 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  29.79 
 
 		 627 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  30.92 
 
 		 588 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  31.35 
 
 		 629 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  29.79 
 
 		 627 aa  246  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  31.35 
 
 		 629 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  31.35 
 
 		 629 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  31.35 
 
 		 629 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  29.25 
 
 		 624 aa  246  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  31.44 
 
 		 629 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  32.18 
 
 		 596 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  31.55 
 
 		 608 aa  243  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  31.31 
 
 		 620 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  32.7 
 
 		 595 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  29.1 
 
 		 626 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  30 
 
 		 611 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>