284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0369 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  70.67 
 
 
466 aa  635    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3706  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  92.17 
 
 
460 aa  827    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2928  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  73.06 
 
 
467 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2858  Cytochrome b/b6 domain protein  71.55 
 
 
466 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702367  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2697  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  92.17 
 
 
460 aa  827    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3092  cytochrome b/b6, N-terminal  70.69 
 
 
467 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3674  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  92.17 
 
 
460 aa  827    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  100 
 
 
460 aa  928    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  97.16 
 
 
459 aa  906    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  98.47 
 
 
459 aa  915    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2976  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  91.96 
 
 
460 aa  843    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3649  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  92.17 
 
 
460 aa  827    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  97.17 
 
 
460 aa  912    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3205  Cytochrome b/b6 domain  71.34 
 
 
466 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  69.2 
 
 
466 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  90.65 
 
 
459 aa  858    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3229  cytochrome b/b6-like protein  71.34 
 
 
467 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  69.53 
 
 
466 aa  674    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  96.74 
 
 
460 aa  909    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  90 
 
 
460 aa  848    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  99.57 
 
 
460 aa  925    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2747  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  92.17 
 
 
460 aa  827    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.936741  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  96.96 
 
 
460 aa  911    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  69.31 
 
 
466 aa  653    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  89.78 
 
 
459 aa  837    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1806  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  92.17 
 
 
460 aa  827    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.557352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3257  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  92.17 
 
 
460 aa  827    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  70.09 
 
 
467 aa  632  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  69.53 
 
 
410 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  67.17 
 
 
470 aa  608  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5502  cytochrome b/b6 domain-containing protein  67.46 
 
 
471 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.189406 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0714  cytochrome b/b6 domain-containing protein  68.51 
 
 
469 aa  597  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.455479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3695  cytochrome b/b6 domain-containing protein  68.17 
 
 
472 aa  594  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.721065  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0753  Cytochrome b/b6 domain protein  67.38 
 
 
473 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0790  cytochrome b/b6 domain-containing protein  67.38 
 
 
473 aa  591  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  63.48 
 
 
433 aa  587  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2965  cytochrome b/b6-like  66.02 
 
 
466 aa  585  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1201  Cytochrome b/b6 domain protein  66.45 
 
 
478 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  66.3 
 
 
422 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  60.99 
 
 
414 aa  547  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  62.08 
 
 
410 aa  541  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  59.86 
 
 
403 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  59.86 
 
 
403 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  60.32 
 
 
747 aa  528  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  61.59 
 
 
403 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  59.01 
 
 
403 aa  522  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  60.23 
 
 
403 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  58.92 
 
 
408 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  60.23 
 
 
404 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  57.62 
 
 
410 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  60.45 
 
 
404 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  60.45 
 
 
404 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  60.65 
 
 
469 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  58.86 
 
 
403 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  57.4 
 
 
413 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  59.77 
 
 
403 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  60.51 
 
 
464 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0795  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.92 
 
 
410 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156903  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  55.63 
 
 
426 aa  504  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  57.82 
 
 
459 aa  502  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  54.69 
 
 
404 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  59.01 
 
 
404 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.56 
 
 
404 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0571  cytochrome b/b6 domain-containing protein  59.55 
 
 
404 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000252718  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0609  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  58.33 
 
 
404 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  54.24 
 
 
404 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1421  cytochrome b, b6 subunit  58.64 
 
 
401 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133027  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3535  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.78 
 
 
404 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000787876  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  59.01 
 
 
404 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1584  cytochrome b/b6-like  58.41 
 
 
401 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.385225  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.11 
 
 
404 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4165  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.56 
 
 
404 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000192419  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3762  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.88 
 
 
404 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3275  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.88 
 
 
404 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000010071  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3888  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.88 
 
 
404 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144736  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0603  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.88 
 
 
404 aa  488  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000103095  normal  0.0561448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3427  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.88 
 
 
404 aa  488  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000389785  normal  0.0470542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0602  cytochrome b/b6 domain-containing protein  58.11 
 
 
404 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000576389  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0563  cytochrome b/b6 domain-containing protein  57.66 
 
 
404 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000189636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3705  Cytochrome b/b6 domain protein  57.66 
 
 
404 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000382146  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  53.78 
 
 
423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0106  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  53.98 
 
 
421 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000729315  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2661  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  54.53 
 
 
422 aa  459  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00823249  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00440  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome B subunit  54.97 
 
 
419 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121242  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004508  ubiquinol--cytochrome c reductase cytochrome B subunit  53.98 
 
 
421 aa  455  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000136312  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  51.11 
 
 
410 aa  456  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00884  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  53.98 
 
 
421 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1362  Cytochrome b/b6 domain  55.63 
 
 
419 aa  448  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.367822  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03380  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome B  51.42 
 
 
421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000214101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  48.38 
 
 
422 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1879  cytochrome b/b6 domain-containing protein  49.56 
 
 
420 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135906  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1944  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome B subunit  50.55 
 
 
430 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0553456  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2730  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  44.49 
 
 
404 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2352  Cytochrome b/b6 domain  44.49 
 
 
404 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.16814  hitchhiker  0.00000000117794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  46.07 
 
 
401 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3110  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  42.31 
 
 
402 aa  363  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.176083  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2708  Cytochrome b/b6 domain  42.31 
 
 
402 aa  363  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000216389  unclonable  0.0000000000381098 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  46.37 
 
 
426 aa  360  3e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  44.3 
 
 
422 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  43.85 
 
 
426 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>