More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0336 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  77.97 
 
 		 588 aa  931    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  77.97 
 
 		 588 aa  931    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  77.97 
 
 		 588 aa  931    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  95.93 
 
 		 589 aa  1161    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  95.59 
 
 		 589 aa  1155    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  77.97 
 
 		 588 aa  930    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  78.47 
 
 		 588 aa  937    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  91.17 
 
 		 589 aa  1090    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  100 
 
 		 589 aa  1206    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  81.11 
 
 		 592 aa  942    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  78.62 
 
 		 584 aa  924    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  95.42 
 
 		 589 aa  1155    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  81.45 
 
 		 583 aa  931    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  58.19 
 
 		 577 aa  707    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  99.49 
 
 		 589 aa  1199    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  95.42 
 
 		 589 aa  1155    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  77.97 
 
 		 588 aa  931    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  77.8 
 
 		 588 aa  929    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  50.54 
 
 		 621 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  50.09 
 
 		 636 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  47.55 
 
 		 578 aa  524  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  47.3 
 
 		 575 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  49.09 
 
 		 614 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  49.09 
 
 		 614 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  49.73 
 
 		 614 aa  510  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  46.35 
 
 		 588 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  46.38 
 
 		 579 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  45.47 
 
 		 586 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  45.01 
 
 		 610 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  48.56 
 
 		 577 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  44.85 
 
 		 613 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  47.08 
 
 		 606 aa  478  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  47.66 
 
 		 572 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  44.57 
 
 		 583 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  44.25 
 
 		 614 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  42.07 
 
 		 599 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  45.47 
 
 		 630 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  42.27 
 
 		 590 aa  464  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  44.87 
 
 		 588 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  45.52 
 
 		 593 aa  458  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  43.68 
 
 		 595 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  42.03 
 
 		 587 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.03 
 
 		 587 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  41.41 
 
 		 708 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  40.07 
 
 		 596 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  41.05 
 
 		 712 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  41.05 
 
 		 704 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  40.53 
 
 		 704 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  39.14 
 
 		 712 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  38.32 
 
 		 600 aa  399  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  37.9 
 
 		 563 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  39.69 
 
 		 713 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  39.54 
 
 		 603 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  39.19 
 
 		 596 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  38 
 
 		 553 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  38.33 
 
 		 701 aa  372  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  36.36 
 
 		 660 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  38.31 
 
 		 557 aa  361  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  34.94 
 
 		 651 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  37.57 
 
 		 615 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  37.38 
 
 		 626 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  36.96 
 
 		 605 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  37.57 
 
 		 602 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  38.12 
 
 		 557 aa  352  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  36.38 
 
 		 606 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.92 
 
 		 598 aa  347  3e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  33.97 
 
 		 674 aa  346  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  37.06 
 
 		 597 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  34.4 
 
 		 642 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  33.39 
 
 		 666 aa  342  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  34.86 
 
 		 591 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  36.28 
 
 		 595 aa  335  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  37.82 
 
 		 560 aa  332  9e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  36.28 
 
 		 609 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  36 
 
 		 668 aa  320  6e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3300  ABC transporter component  35.23 
 
 		 629 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0603  ABC transporter domain protein  36.73 
 
 		 596 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  34.36 
 
 		 534 aa  309  8e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1490  transporter, putative  32.2 
 
 		 621 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00776533  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1686  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein yddA  33.15 
 
 		 561 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.42 
 
 		 549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2150  ABC transporter related protein  32.97 
 
 		 561 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2161  ABC transporter related  32.97 
 
 		 561 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  34.9 
 
 		 665 aa  306  6e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1581  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  32.97 
 
 		 561 aa  306  7e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.477042  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1444  putative transporter  32.02 
 
 		 621 aa  306  7e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2109  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  32.97 
 
 		 561 aa  306  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.356794  normal  0.522774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  36.57 
 
 		 667 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01454  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  32.78 
 
 		 561 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01467  hypothetical protein  32.78 
 
 		 561 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  34.29 
 
 		 567 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1677  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  32.72 
 
 		 561 aa  303  8.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3439  ABC transporter related  33.51 
 
 		 588 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1760  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  32.6 
 
 		 561 aa  301  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  34.69 
 
 		 603 aa  300  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1678  ABC transporter  32.86 
 
 		 623 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  34 
 
 		 576 aa  300  7e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  34.87 
 
 		 663 aa  299  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  34.87 
 
 		 663 aa  299  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  34.29 
 
 		 576 aa  296  8e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>