More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0321 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  90.25 
 
 		 359 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  90.25 
 
 		 359 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 359 aa  723    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  90.25 
 
 		 359 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  96.66 
 
 		 359 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  96.38 
 
 		 359 aa  681    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  89.94 
 
 		 358 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  96.94 
 
 		 359 aa  705    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  89.58 
 
 		 361 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  97.21 
 
 		 359 aa  705    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  90.25 
 
 		 359 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  90.25 
 
 		 359 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  90.25 
 
 		 359 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  90.25 
 
 		 359 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  99.44 
 
 		 359 aa  719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  97.21 
 
 		 359 aa  705    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  87.85 
 
 		 363 aa  628  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  88.45 
 
 		 361 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  73.03 
 
 		 368 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  71.47 
 
 		 368 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  71.47 
 
 		 368 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  71.35 
 
 		 368 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  70.51 
 
 		 368 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  64.43 
 
 		 361 aa  478  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  66.76 
 
 		 359 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  67.7 
 
 		 370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  64.15 
 
 		 361 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  67.05 
 
 		 368 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  65.25 
 
 		 370 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  65.34 
 
 		 372 aa  451  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  63.82 
 
 		 372 aa  448  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  63.26 
 
 		 367 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  63.26 
 
 		 367 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  65.34 
 
 		 373 aa  441  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  63.25 
 
 		 388 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0840  3-dehydroquinate synthase  65.99 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  60.94 
 
 		 365 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  61.25 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  63.53 
 
 		 376 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  61.22 
 
 		 365 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  62.68 
 
 		 364 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  60.94 
 
 		 365 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  59.89 
 
 		 373 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  62.01 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  60.66 
 
 		 376 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  60.23 
 
 		 366 aa  421  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  59.89 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  61.77 
 
 		 368 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  61.24 
 
 		 367 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  61.5 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  59.56 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  57.26 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  59.83 
 
 		 366 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  61.7 
 
 		 365 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  59.56 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  56.23 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  57.26 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  55.68 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  55.39 
 
 		 354 aa  388  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  59.56 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  56.06 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  56.06 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  57.58 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  59.28 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0016  3-dehydroquinate synthase  58.76 
 
 		 373 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  59.28 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  57.22 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  59.28 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  59.28 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  59.28 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  55.46 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  53.89 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  56.1 
 
 		 368 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  57.22 
 
 		 364 aa  381  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  52.23 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  56.18 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  53.87 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  55.99 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  56.38 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  56.47 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  54.44 
 
 		 359 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  56.5 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  54.44 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  57.4 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  53.78 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  58.98 
 
 		 362 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  55.69 
 
 		 358 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  56.3 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  58.98 
 
 		 362 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  58.98 
 
 		 362 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  55.39 
 
 		 358 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  55.39 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  58.98 
 
 		 362 aa  368  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  58.68 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  57.56 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  53.24 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  57.56 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  58.68 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  57.56 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  58.68 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>