142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0219 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  100 
 
 		 119 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  96.64 
 
 		 119 aa  205  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  88.79 
 
 		 117 aa  202  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  88.79 
 
 		 117 aa  202  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  88.79 
 
 		 117 aa  202  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  85 
 
 		 120 aa  200  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  78.15 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3145  cytochrome c family protein  76.58 
 
 		 111 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0038  cytochrome c family protein  87.21 
 
 		 228 aa  158  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0021  cytochrome c family protein  87.21 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.042023  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1745  cytochrome c family protein  87.21 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3816  cytochrome c family protein  87.21 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3897  cytochrome c family protein  87.21 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3179  cytochrome c family protein  87.21 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2798  cytochrome c family protein  87.21 
 
 		 111 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.023573  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0126  cytochrome c class I  73.81 
 
 		 115 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  71.91 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  73.03 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  67.07 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  65.85 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  65.06 
 
 		 115 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  65.06 
 
 		 115 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3260  cytochrome C transmembrane protein  68.83 
 
 		 141 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0037  cytochrome c, class I  53.09 
 
 		 117 aa  106  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000534033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  55.26 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  50.57 
 
 		 106 aa  96.7  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  46.39 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  53.06 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  51.32 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0344  cytochrome c, class I  43.69 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0270928  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  49.38 
 
 		 344 aa  94  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  48.51 
 
 		 360 aa  92.8  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  52.05 
 
 		 208 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  48.72 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  46.51 
 
 		 348 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  49.47 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  55.71 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  54.43 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  44.33 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2879  cytochrome c, class I  50 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.578668 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  44.09 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1386  cytochrome c551/c552-like protein  50 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660069  normal  0.798955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  51.32 
 
 		 101 aa  89.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  48 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  51.32 
 
 		 101 aa  89.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  47.25 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1006  cytochrome c, class I  41.82 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  55.26 
 
 		 102 aa  88.6  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2122  cytochrome c class I  47.73 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1037  cytochrome c class I  52.27 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.692369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  44.79 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1163  cytochrome c class I  39.81 
 
 		 197 aa  87  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000127727  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2222  cytochrome c class I  41.41 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1852  cytochrome c, class I  37.72 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2463  cytochrome c, class I  37.72 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2468  cytochrome c class I  37.72 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  47.37 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  46.05 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2536  cytochrome c class I  46.59 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 800 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3171  cytochrome c, class I  49.35 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  46.84 
 
 		 218 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5011  cytochrome c, class I  50 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259324  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  35.78 
 
 		 249 aa  85.1  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2512  cytochrome c, class I  36.45 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  35.25 
 
 		 941 aa  83.6  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  45.65 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3038  cytochrome c, class I  43.42 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277662  normal  0.17422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0728  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0783308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  52.7 
 
 		 355 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2380  cytochrome c class I  41.98 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  34.17 
 
 		 908 aa  81.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3648  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0826  cytochrome c subfamily protein  41.25 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0831  cytochrome c class I  43.75 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0675  cytochrome c family protein  41.25 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414538  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  53.62 
 
 		 918 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  47.5 
 
 		 404 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2336  cytochrome c family protein  41.25 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.1845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2950  cytochrome c family protein  41.25 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1025  cytochrome c family protein  41.25 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1650  cytochrome c family protein  41.25 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503452  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1179  cytochrome C552 precursor  41.25 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1018  cytochrome c family protein  41.25 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0243798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  38.3 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1140  cytochrome c family protein  35.78 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1693  cytochrome c class I  45.78 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.504006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0629  putative oxidoreductase cytochrome C552 precursor signal peptide protein  47.06 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  39.53 
 
 		 1151 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5897  cytochrome c class I  44 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3888  cytochrome c class I  41.11 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1962  cytochrome c family protein  41.77 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  40.51 
 
 		 1138 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  40.54 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1630  cytochrome c class I  41.77 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000303587  hitchhiker  0.0000000150302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  35.19 
 
 		 1143 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5907  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0867069  normal  0.452961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3346  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.817826  normal  0.315535 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>