More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0164 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 833 aa  1659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  52.61 
 
 		 824 aa  792    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  67.88 
 
 		 732 aa  915    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  62.11 
 
 		 828 aa  957    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  66.22 
 
 		 828 aa  1051    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  49.28 
 
 		 789 aa  725    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  96.28 
 
 		 833 aa  1545    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  66.59 
 
 		 828 aa  1053    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  46.81 
 
 		 754 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  48.37 
 
 		 708 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  46.81 
 
 		 754 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  50.17 
 
 		 598 aa  505  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  50.34 
 
 		 619 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  49.66 
 
 		 595 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  47.77 
 
 		 626 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 		 789 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 909 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.1 
 
 		 816 aa  334  4e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 968 aa  325  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 1094 aa  321  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.06 
 
 		 1106 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 718 aa  314  4.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 		 3035 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 1714 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.96 
 
 		 589 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  33.87 
 
 		 596 aa  303  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  31.14 
 
 		 708 aa  299  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.77 
 
 		 739 aa  296  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 1106 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 717 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.12 
 
 		 589 aa  294  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  34.7 
 
 		 717 aa  292  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  37.71 
 
 		 585 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  38.68 
 
 		 1221 aa  285  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.06 
 
 		 739 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.83 
 
 		 667 aa  282  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 713 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 750 aa  280  7e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 4489 aa  280  7e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  30.55 
 
 		 699 aa  279  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.23 
 
 		 739 aa  276  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  32.24 
 
 		 1415 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  31.6 
 
 		 937 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  36.09 
 
 		 781 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 796 aa  273  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 		 633 aa  272  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 808 aa  271  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 693 aa  268  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.59 
 
 		 723 aa  266  8e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 776 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.28 
 
 		 715 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  34.65 
 
 		 780 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 780 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  32.75 
 
 		 821 aa  260  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  33.1 
 
 		 776 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  33.1 
 
 		 821 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  33.1 
 
 		 776 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  33.1 
 
 		 776 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1085 aa  259  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 776 aa  259  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 627 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 700 aa  258  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.58 
 
 		 742 aa  258  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 1143 aa  257  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.14 
 
 		 529 aa  257  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.15 
 
 		 740 aa  257  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 779 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 734 aa  255  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  29.89 
 
 		 797 aa  253  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  33.03 
 
 		 790 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 822 aa  243  7.999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 633 aa  242  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 733 aa  241  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  38.17 
 
 		 727 aa  239  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.18 
 
 		 790 aa  239  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  29.9 
 
 		 1116 aa  235  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.77 
 
 		 3560 aa  230  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  33.51 
 
 		 921 aa  225  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  27.54 
 
 		 1144 aa  220  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  35.68 
 
 		 552 aa  219  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.73 
 
 		 810 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.68 
 
 		 878 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.1 
 
 		 1154 aa  212  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 667 aa  211  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.4 
 
 		 793 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 654 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 739 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 647 aa  205  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 706 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  37.66 
 
 		 681 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 732 aa  195  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 		 632 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  31.57 
 
 		 574 aa  194  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 740 aa  194  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 		 724 aa  193  9e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 974 aa  193  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 750 aa  191  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  32.32 
 
 		 492 aa  190  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 761 aa  188  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 611 aa  187  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>