More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0093 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  99.21 
 
 		 252 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  96.79 
 
 		 251 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  96.79 
 
 		 251 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  96.79 
 
 		 251 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  96.39 
 
 		 251 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  95.58 
 
 		 251 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  88.84 
 
 		 254 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  87.95 
 
 		 250 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3983  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  87.24 
 
 		 251 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  87.24 
 
 		 251 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2943  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  86.83 
 
 		 251 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  86.83 
 
 		 251 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3368  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  86.83 
 
 		 251 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1600  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  86.83 
 
 		 252 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671798  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3002  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  86.83 
 
 		 251 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3321  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  85.19 
 
 		 252 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3040  ABC transporter related  85.43 
 
 		 253 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  82.79 
 
 		 247 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  81.15 
 
 		 247 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  82.38 
 
 		 247 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  82.38 
 
 		 247 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  77.46 
 
 		 247 aa  387  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3234  ABC transporter related  67.48 
 
 		 248 aa  345  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  67.07 
 
 		 270 aa  324  8.000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  63.45 
 
 		 247 aa  314  7e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  65.43 
 
 		 251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  62.96 
 
 		 249 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  64.61 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  61.63 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  63.64 
 
 		 248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  60 
 
 		 253 aa  301  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  61.07 
 
 		 252 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  57.85 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  61.34 
 
 		 243 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  55.79 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  56.73 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  58.68 
 
 		 239 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  60.66 
 
 		 252 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  57.96 
 
 		 249 aa  276  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5330  ABC transporter related  59.11 
 
 		 251 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.240884  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  57.68 
 
 		 249 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3247  putative high-affinity branched-chain amino acid transport protein, ATP binding protein  59.48 
 
 		 231 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0998  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.56 
 
 		 271 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  57.02 
 
 		 239 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  55.74 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  57.85 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  55.37 
 
 		 248 aa  265  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3890  ABC transporter related  53.54 
 
 		 255 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1227  ABC transporter related  55.92 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  49.17 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.24 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  51.43 
 
 		 247 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  53.06 
 
 		 247 aa  244  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  51.02 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  52.24 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  51.43 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  49.58 
 
 		 247 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  49.58 
 
 		 247 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  50.41 
 
 		 237 aa  241  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  48.95 
 
 		 233 aa  241  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  49.58 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.25 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  51.43 
 
 		 247 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 		 234 aa  239  4e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.84 
 
 		 234 aa  238  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  50.21 
 
 		 236 aa  238  8e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  48.75 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  50.83 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  50 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  52.72 
 
 		 258 aa  235  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  50.84 
 
 		 235 aa  234  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.84 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  50.42 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  51.68 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  50.63 
 
 		 241 aa  232  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  50.63 
 
 		 241 aa  232  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  47.5 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  50.21 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0288  ABC transporter related  51.67 
 
 		 241 aa  231  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  48.32 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  50.63 
 
 		 241 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  51.02 
 
 		 244 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  49.58 
 
 		 239 aa  231  9e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  48.97 
 
 		 264 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  50 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  48.95 
 
 		 234 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  49.37 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  49.01 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  50.63 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  47.3 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  48.77 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  50.42 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  47.18 
 
 		 244 aa  228  7e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  48.55 
 
 		 236 aa  228  7e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  49.18 
 
 		 235 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.5 
 
 		 238 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>