17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0048 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0048  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  193  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0039  hypothetical protein  95.74 
 
 
94 aa  186  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0068  hypothetical protein  92.55 
 
 
94 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.756917  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3231  hypothetical protein  90.43 
 
 
94 aa  180  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.315691  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0021  hypothetical protein  92.63 
 
 
95 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178292  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0049  hypothetical protein  92.63 
 
 
95 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0050  hypothetical protein  84.27 
 
 
91 aa  153  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725453  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2772  hypothetical protein  69.23 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3505  hypothetical protein  62.77 
 
 
93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1877  hypothetical protein  62.77 
 
 
93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0021  hypothetical protein  59.14 
 
 
94 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2675  hypothetical protein  69.23 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.106637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0233  hypothetical protein  67.57 
 
 
106 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0020  hypothetical protein  71.01 
 
 
103 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0021  hypothetical protein  59.77 
 
 
90 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0867544  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4488  hypothetical protein  49.25 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000550656  hitchhiker  0.00041923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3949  hypothetical protein  53.03 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.547284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>