More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0030 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0029  outer membrane protein (porin)-like protein  94.95 
 
 		 375 aa  734    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0021  outer membrane protein (porin)-like protein  96.58 
 
 		 409 aa  816    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0048  porin  95.48 
 
 		 375 aa  738    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3214  outer membrane protein (porin)-like  94.06 
 
 		 701 aa  794    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84124  normal  0.834599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0030  outer membrane protein (porin)-like protein  100 
 
 		 409 aa  840    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0041  outer membrane protein (porin)-like  94.31 
 
 		 435 aa  783    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0031  outer membrane protein (porin)-like protein  91.51 
 
 		 377 aa  723    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3278  putative outer membrane porin  82.68 
 
 		 386 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0256  outer membrane porin, putative  82.68 
 
 		 406 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2703  putative outer membrane porin  82.68 
 
 		 386 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1849  putative outer membrane porin  82.68 
 
 		 386 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0044  putative porin  82.68 
 
 		 386 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0044  putative porin  82.68 
 
 		 386 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2675  outer membrane porin, putative  82.45 
 
 		 375 aa  620  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0040  porin  82.18 
 
 		 375 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4041  porin Gram-negative type  67.65 
 
 		 374 aa  534  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3390  porin signal peptide protein  51.37 
 
 		 376 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0795633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3279  porin Gram-negative type  52.39 
 
 		 375 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3601  porin Gram-negative type  51.83 
 
 		 375 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.939014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  31.38 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  31.74 
 
 		 386 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  33.25 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  32.81 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  32.29 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  32.02 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  32.02 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  32.02 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  29.61 
 
 		 368 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  36.36 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  31.81 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  31.81 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  31.52 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  31.81 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  31.81 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  31.81 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  29.85 
 
 		 381 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  31.06 
 
 		 391 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  29.02 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  30.75 
 
 		 384 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.41 
 
 		 358 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  29.78 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  31.13 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  31.06 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  29.01 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  28.33 
 
 		 367 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  31.67 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  28.36 
 
 		 352 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  30.83 
 
 		 379 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  30.68 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  30.68 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  30.68 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  30.68 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  30.68 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  30.21 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  30.17 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4019  OmpC family outer membrane porin  29.69 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000373158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  29.78 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  29.08 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  29.78 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  29.4 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  29.58 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  29.58 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  29.58 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  28.5 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  29.76 
 
 		 365 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  27.51 
 
 		 385 aa  103  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  30.15 
 
 		 384 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  34.2 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  31.55 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  29.87 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  34.2 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  30.47 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  34.2 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  34.2 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  28.86 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  35.53 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  29.2 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  28.94 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  28.94 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  28.94 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  29.18 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  28.94 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  28.54 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  28.94 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  28.94 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2320  outer membrane protein (porin)-like  29.8 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  28.94 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  30.31 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  30.15 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  35.09 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  29.18 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0680  porin Gram-negative type  30.05 
 
 		 373 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  29.12 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  28.42 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  29.18 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  29.2 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  29.87 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  32.2 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  29.46 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  29.9 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>