28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0026 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0026  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2388  hypothetical protein  62.2 
 
 
84 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2888  hypothetical protein  51.11 
 
 
152 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1247  hypothetical protein  52.5 
 
 
172 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2983  hypothetical protein  46.39 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00581443  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1633  hypothetical protein  48.15 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0137  hypothetical protein  41.67 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2338  hypothetical protein  41.67 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0918492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2317  hypothetical protein  41.67 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1530  hypothetical protein  48.15 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2821  hypothetical protein  41.67 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0130  hypothetical protein  41.67 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1307  hypothetical protein  48.15 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0563  hypothetical protein  48.15 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1500  hypothetical protein  48.15 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0589  hypothetical protein  48.15 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.920476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0794  hypothetical protein  48.15 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475725  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0742  hypothetical protein  48.1 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.672077  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0337  hypothetical protein  40.62 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.043628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1324  hypothetical protein  41.67 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2298  hypothetical protein  43.75 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2186  hypothetical protein  43.75 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3339  hypothetical protein  45.68 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595806  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0100  hypothetical protein  39.76 
 
 
177 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1675  hypothetical protein  37.76 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1238  hypothetical protein  36.96 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.35146  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5374  hypothetical protein  37.8 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303606  normal  0.45291 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1282  hypothetical protein  58.82 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.250651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>