30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0024 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0024  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0017  hypothetical protein  98.98 
 
 		 100 aa  186  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0046  hypothetical protein  91.09 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0042  hypothetical protein  91.09 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0024  hypothetical protein  91.09 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3209  hypothetical protein  81.13 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2910  signal peptide protein  50 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0237846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1207  hypothetical protein  62.24 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.672501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5162  signal peptide protein  46.36 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0025  hypothetical protein  74.26 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4655  signal peptide protein  49.33 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4523  putative signal peptide protein  49.33 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2807  signal peptide protein  50 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3156  putative signal peptide protein  50 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.910812  hitchhiker  0.0019491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1721  hypothetical protein  46.67 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169601  hitchhiker  0.0000197195 
 
 
-
 
NC_003296  RS01741  signal peptide protein  43.84 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1532  hypothetical protein  46.07 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1052  hypothetical protein  46.07 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5324  hypothetical protein  49.07 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4672  hypothetical protein  41.67 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951454  hitchhiker  0.00900362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1508  hypothetical protein  42.27 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  hitchhiker  0.000360892 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1779  hypothetical protein  54.39 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00129784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1800  hypothetical protein  54.39 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00446832  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0128  hypothetical protein  49.12 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000200188  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1037  hypothetical protein  49.12 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0395947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1767  hypothetical protein  49.12 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0030086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1955  hypothetical protein  54.39 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252665  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2531  hypothetical protein  53.33 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5177  signal peptide protein  63.41 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0909  hypothetical protein  47.73 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>