61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2963 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  89.33 
 
 		 301 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  89.33 
 
 		 301 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  95.73 
 
 		 327 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  91.16 
 
 		 301 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  73.72 
 
 		 288 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  99.38 
 
 		 179 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  99.38 
 
 		 174 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  79.35 
 
 		 231 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1597  hypothetical protein  98.72 
 
 		 78 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  52.55 
 
 		 241 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  45.36 
 
 		 232 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  39.86 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  38.03 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  34.07 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  32.28 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  37.62 
 
 		 208 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  34.88 
 
 		 478 aa  69.3  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  34.45 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  34.57 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  31.85 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  55.93 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  61.22 
 
 		 709 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  56.67 
 
 		 717 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  38.82 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  34.41 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  33.08 
 
 		 2851 aa  57  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  28.43 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0696  ribonuclease G  47.46 
 
 		 868 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  30.21 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  39.76 
 
 		 222 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  46.94 
 
 		 704 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  35.11 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  35.29 
 
 		 176 aa  50.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  27.07 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  51.16 
 
 		 523 aa  49.7  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  50.91 
 
 		 444 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3646  transcription termination factor Rho  68.97 
 
 		 675 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0760  PSP1 domain protein  63.89 
 
 		 558 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  48.84 
 
 		 674 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04697  hypothetical protein  28.42 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00670178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  55.81 
 
 		 451 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  55.81 
 
 		 439 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  46.94 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0439  cold-shock DEAD box protein A (ATP-independent RNA helicase)  59.46 
 
 		 641 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0892  hypothetical protein  62.5 
 
 		 425 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  55.81 
 
 		 437 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  55.81 
 
 		 437 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  55.81 
 
 		 437 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  55.81 
 
 		 438 aa  43.5  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6680  putative cytoplasmic protein  32.65 
 
 		 268 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2351  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  36.47 
 
 		 233 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2187  hypothetical protein  35.29 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1198 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  31.16 
 
 		 2914 aa  42.7  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  31.91 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  48.84 
 
 		 283 aa  42.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  55.81 
 
 		 645 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>