14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2913 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2913  outer membrane protein  100 
 
 
301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110077  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2757  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1140  lectin  99.14 
 
 
232 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0310  antifungal protein precursor, putative  88.79 
 
 
230 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.375674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1092  curculin-like (mannose-binding) lectin  28.8 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000112862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1572  curculin domain-containing protein  28.8 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1548  curculin domain-containing protein  28.8 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000088677  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1547  curculin domain-containing protein  29.15 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000198605  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1091  curculin-like (mannose-binding) lectin  29.15 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000304641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1571  curculin domain-containing protein  29.15 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00304753  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  28.84 
 
 
788 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  30.63 
 
 
374 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4524  curculin domain-containing protein  30.63 
 
 
226 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.465524  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  29.77 
 
 
777 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>