More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2507 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 
745 aa  1519    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  59.02 
 
 
688 aa  792    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  62.04 
 
 
719 aa  823    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  86.09 
 
 
710 aa  1179    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  52.22 
 
 
676 aa  673    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  98.79 
 
 
745 aa  1498    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  52.07 
 
 
676 aa  670    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  98.4 
 
 
749 aa  1462    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  86.74 
 
 
713 aa  1182    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  98.66 
 
 
749 aa  1481    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  58.53 
 
 
688 aa  791    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  61.75 
 
 
710 aa  811    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  98.79 
 
 
745 aa  1498    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  87.46 
 
 
710 aa  1194    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  58.81 
 
 
688 aa  794    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  93.09 
 
 
753 aa  1389    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  54.32 
 
 
726 aa  716    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  54.59 
 
 
687 aa  723    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  52.24 
 
 
681 aa  699    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  98.79 
 
 
745 aa  1498    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  86.85 
 
 
687 aa  1189    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  53.1 
 
 
669 aa  681    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  52.1 
 
 
681 aa  698    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  57.67 
 
 
698 aa  746    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  65.32 
 
 
724 aa  918    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  57.8 
 
 
725 aa  746    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  86.09 
 
 
710 aa  1179    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  52.03 
 
 
686 aa  702    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  59.16 
 
 
688 aa  803    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  79.33 
 
 
709 aa  1182    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  62.2 
 
 
723 aa  828    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  54.19 
 
 
684 aa  716    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  86.09 
 
 
710 aa  1179    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  45.86 
 
 
691 aa  575  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  45.25 
 
 
686 aa  544  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  40.33 
 
 
661 aa  438  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  40.34 
 
 
667 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  39.1 
 
 
662 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  39.2 
 
 
668 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  39.2 
 
 
668 aa  415  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  38.06 
 
 
668 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  38.04 
 
 
663 aa  399  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  37.2 
 
 
667 aa  385  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  32.46 
 
 
695 aa  298  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 
672 aa  258  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 
697 aa  237  7e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.5 
 
 
665 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 
699 aa  235  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 
668 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  25.52 
 
 
699 aa  169  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 
768 aa  167  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 
702 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 
681 aa  153  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 
702 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 
760 aa  145  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 
673 aa  144  6e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 
702 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 
661 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 
698 aa  109  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 
696 aa  106  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 
793 aa  104  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 
716 aa  101  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  23.72 
 
 
775 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 
684 aa  99.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  21.05 
 
 
780 aa  95.9  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 
721 aa  90.5  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 
769 aa  88.2  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 
685 aa  88.2  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 
751 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 
744 aa  86.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.32 
 
 
625 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 
718 aa  85.1  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 
692 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 
751 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 
698 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 
698 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 
681 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  23.57 
 
 
764 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 
681 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 
725 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 
713 aa  84  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.73 
 
 
861 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 
698 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 
742 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 
677 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 
724 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  21.75 
 
 
741 aa  82  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 
677 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  29.54 
 
 
764 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 
683 aa  81.3  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 
693 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  20.93 
 
 
708 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  21.45 
 
 
766 aa  79  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  24.62 
 
 
772 aa  78.6  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 
694 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 
706 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  23.21 
 
 
775 aa  77  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  20.19 
 
 
713 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 
767 aa  76.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 
705 aa  76.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>