18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1660 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1660  phosphopantetheine attachment site, putative  100 
 
 
79 aa  163  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0832602  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1580  phosphopantetheine attachment site, putative  98.73 
 
 
79 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861905  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1225  phosphopantetheine-containing protein  91.14 
 
 
81 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6050  acyl carrier protein  63.16 
 
 
82 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00630342  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5820  acyl carrier protein  61.84 
 
 
82 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.185115  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  37.5 
 
 
4186 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4624  aspartate racemase  39.34 
 
 
856 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0240393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21190  enterochelin sythetase component F (Serine-activating enzyme) (Seryl-AMP ligase)  41.18 
 
 
1330 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  35.09 
 
 
3108 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1976  amino acid adenylation  27.78 
 
 
1373 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5089  Aspartate racemase  39.34 
 
 
856 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3070  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.38 
 
 
1208 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0974  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 
2142 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  35.85 
 
 
4960 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  35.85 
 
 
4960 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  44.9 
 
 
6403 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  27.42 
 
 
2706 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  35.48 
 
 
2614 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>