More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1483 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1200  EmrB/QacA family drug resistance transporter  98.75 
 
 
478 aa  773    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.79 
 
 
480 aa  909    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  98.75 
 
 
478 aa  773    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  98.96 
 
 
478 aa  773    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  100 
 
 
480 aa  911    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  99.79 
 
 
480 aa  909    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  98.96 
 
 
478 aa  773    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.74 
 
 
479 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  74.05 
 
 
479 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.84 
 
 
479 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.84 
 
 
479 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78.1 
 
 
480 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  77.88 
 
 
480 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  76.3 
 
 
479 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  73.48 
 
 
502 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78.1 
 
 
480 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78.1 
 
 
480 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  78.1 
 
 
480 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78.1 
 
 
480 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78.1 
 
 
480 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  77.15 
 
 
548 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  72 
 
 
482 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  72 
 
 
482 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0272  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  73.81 
 
 
494 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  68.76 
 
 
497 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.26 
 
 
487 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.14 
 
 
481 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4076  major facilitator transporter  70.65 
 
 
437 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.45 
 
 
490 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.53 
 
 
534 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.35 
 
 
496 aa  350  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.89 
 
 
507 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.59 
 
 
498 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.19 
 
 
553 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.23 
 
 
1112 aa  339  8e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  48.53 
 
 
492 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.82 
 
 
487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.64 
 
 
487 aa  323  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.11 
 
 
482 aa  321  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.54 
 
 
506 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.78 
 
 
763 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  46.07 
 
 
513 aa  313  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.67 
 
 
527 aa  299  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.91 
 
 
487 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  41.43 
 
 
494 aa  289  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.32 
 
 
489 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.22 
 
 
508 aa  280  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  43.36 
 
 
492 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.38 
 
 
493 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  41.38 
 
 
497 aa  272  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.63 
 
 
519 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.76 
 
 
474 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.76 
 
 
788 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  45.08 
 
 
477 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.69 
 
 
514 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 
522 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.88 
 
 
519 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.37 
 
 
509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  42.29 
 
 
505 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5138  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 
477 aa  252  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.21 
 
 
487 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.24 
 
 
478 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.85 
 
 
473 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  40.58 
 
 
490 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  38.41 
 
 
491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  39.11 
 
 
475 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.91 
 
 
500 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 
499 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.12 
 
 
499 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 
487 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  42.61 
 
 
454 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  41.63 
 
 
489 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  40.26 
 
 
483 aa  233  5e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  43.04 
 
 
471 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  39.83 
 
 
481 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  39.41 
 
 
472 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  40.39 
 
 
485 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  40.21 
 
 
489 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  39.14 
 
 
470 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 
478 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.9 
 
 
498 aa  226  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  40.36 
 
 
501 aa  225  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.03 
 
 
522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4680  major facilitator superfamily MFS_1  40.23 
 
 
467 aa  221  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  36.96 
 
 
481 aa  220  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.71 
 
 
540 aa  219  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 
478 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 
506 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.19 
 
 
469 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 
503 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.59 
 
 
512 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.48 
 
 
502 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.32 
 
 
504 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  42.44 
 
 
518 aa  216  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.47 
 
 
469 aa  216  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  35.6 
 
 
530 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.26 
 
 
505 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  36.66 
 
 
528 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 
483 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  39.9 
 
 
463 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>