More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1303 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  100 
 
 
362 aa  731    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  99.72 
 
 
362 aa  731    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  99.72 
 
 
383 aa  729    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  99.72 
 
 
362 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  99.72 
 
 
397 aa  731    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  99.72 
 
 
432 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  94.48 
 
 
496 aa  677    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  99.72 
 
 
383 aa  729    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  71.98 
 
 
359 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  72.53 
 
 
359 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  72.53 
 
 
359 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  71.98 
 
 
359 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  71.98 
 
 
359 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  71.98 
 
 
359 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  71.27 
 
 
357 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  73.28 
 
 
359 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  69.06 
 
 
357 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  69.34 
 
 
357 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  52.49 
 
 
357 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0260  outer membrane protein (porin)  50.15 
 
 
373 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4632  porin Gram-negative type  46.13 
 
 
368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.656997 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  43.09 
 
 
366 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  43.09 
 
 
366 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  41.08 
 
 
380 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  41.08 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  38.68 
 
 
355 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000457721  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  38.23 
 
 
384 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  39.35 
 
 
380 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  40.65 
 
 
378 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  39.53 
 
 
383 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  38.56 
 
 
380 aa  209  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  39.08 
 
 
380 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  37.78 
 
 
386 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  39.28 
 
 
383 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  39.15 
 
 
379 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4894  porin  37.87 
 
 
361 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  38.04 
 
 
386 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  37.6 
 
 
380 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  37.59 
 
 
384 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  40.7 
 
 
383 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  37.89 
 
 
383 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  37.67 
 
 
383 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  38.02 
 
 
390 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2803  OmpC family outer membrane porin  38.57 
 
 
360 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011499  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  38.66 
 
 
381 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  37.09 
 
 
384 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  37.09 
 
 
384 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  37.63 
 
 
383 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  37.61 
 
 
382 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  36.75 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  36.75 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  36.75 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  38.54 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  38.62 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  37 
 
 
387 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  36.84 
 
 
384 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  39.39 
 
 
409 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  37.15 
 
 
384 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  36.39 
 
 
387 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  36.59 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  37.87 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  38.32 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  38.68 
 
 
396 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  37.76 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  37.92 
 
 
372 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  38.17 
 
 
379 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  35.43 
 
 
383 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  39.39 
 
 
358 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  37.34 
 
 
379 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  37.08 
 
 
379 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  37.08 
 
 
379 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  37.08 
 
 
379 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  39.48 
 
 
381 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  37.08 
 
 
379 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  40 
 
 
385 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  35.81 
 
 
379 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  36.94 
 
 
387 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  36.9 
 
 
381 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  37.47 
 
 
394 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  36.04 
 
 
411 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  38.14 
 
 
385 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  37.31 
 
 
375 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  37.89 
 
 
385 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  37.11 
 
 
381 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  37.7 
 
 
367 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  38.4 
 
 
375 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  36.65 
 
 
388 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  37.56 
 
 
375 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  37.56 
 
 
375 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  39.33 
 
 
365 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  35.98 
 
 
385 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  39.33 
 
 
365 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  39.33 
 
 
365 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  39.33 
 
 
365 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  35.95 
 
 
422 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  38.12 
 
 
384 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1102  outer membrane porin  39.33 
 
 
358 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  37.76 
 
 
383 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  37.28 
 
 
383 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  35.71 
 
 
385 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>