More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0939 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  73.21 
 
 
804 aa  1063  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  99.16 
 
 
728 aa  1435  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  99.16 
 
 
933 aa  1454  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  72.08 
 
 
796 aa  1053  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  49.79 
 
 
767 aa  663  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  72.08 
 
 
813 aa  1045  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  73.35 
 
 
803 aa  1064  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  2.95709e-05 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  73.35 
 
 
803 aa  1064  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  90.46 
 
 
930 aa  1295  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  100 
 
 
714 aa  1449  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  72.35 
 
 
798 aa  1049  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  3.95852e-07 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  87.59 
 
 
852 aa  1258  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  99.16 
 
 
945 aa  1457  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  90.46 
 
 
920 aa  1295  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  73.08 
 
 
803 aa  1057  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  52.04 
 
 
667 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  36.97 
 
 
777 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  35.67 
 
 
753 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  36.36 
 
 
790 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  36.45 
 
 
750 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  32.62 
 
 
745 aa  346  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  33.29 
 
 
733 aa  345  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  32.83 
 
 
727 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  2.93733e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  32.36 
 
 
728 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  32.61 
 
 
728 aa  342  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  32.69 
 
 
751 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  32.41 
 
 
728 aa  337  4e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  31.56 
 
 
741 aa  328  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  31.81 
 
 
737 aa  328  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  34.21 
 
 
728 aa  326  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  33.52 
 
 
748 aa  325  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  34.03 
 
 
728 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  31.19 
 
 
738 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  3.04178e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  31.33 
 
 
738 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  9.66561e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  31.19 
 
 
737 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  31.05 
 
 
738 aa  315  2e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  29.74 
 
 
735 aa  313  7e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  7.55516e-06  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  30.92 
 
 
736 aa  312  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  31.38 
 
 
734 aa  309  9e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  31.28 
 
 
739 aa  308  2e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  30.81 
 
 
738 aa  308  2e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  30.8 
 
 
738 aa  308  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  30.6 
 
 
738 aa  307  5e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  30.83 
 
 
738 aa  302  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  30.46 
 
 
737 aa  300  7e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  30.14 
 
 
735 aa  295  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  29.67 
 
 
754 aa  294  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  29.56 
 
 
751 aa  293  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  6.72418e-09 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  29.31 
 
 
729 aa  283  6e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  30.84 
 
 
764 aa  283  6e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  29.86 
 
 
745 aa  283  9e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  28.15 
 
 
771 aa  256  1e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  27.9 
 
 
733 aa  251  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  28.24 
 
 
776 aa  247  5e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  26.34 
 
 
740 aa  224  5e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  24.83 
 
 
760 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  26.16 
 
 
740 aa  194  5e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  35.04 
 
 
707 aa  180  7e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  35.93 
 
 
720 aa  180  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.42926e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  38.87 
 
 
256 aa  174  4e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  30.05 
 
 
746 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  1.24103e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  35.97 
 
 
311 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  37.17 
 
 
333 aa  164  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  36.84 
 
 
320 aa  163  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  36.84 
 
 
320 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  36.43 
 
 
302 aa  161  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  37.93 
 
 
981 aa  160  9e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  38.3 
 
 
330 aa  160  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  1.89708e-05 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  34.43 
 
 
263 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  3.90545e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  37.23 
 
 
315 aa  159  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.63376e-05  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  36.88 
 
 
317 aa  157  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  7.66649e-06  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  37.23 
 
 
305 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  37.23 
 
 
305 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  5.44738e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  37.23 
 
 
306 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  37.5 
 
 
273 aa  155  3e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  37.23 
 
 
302 aa  155  3e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  38.3 
 
 
474 aa  155  3e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  4.6656e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  37.23 
 
 
349 aa  155  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  2.27608e-05  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  38.3 
 
 
347 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  2.14716e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  38.3 
 
 
347 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  37.23 
 
 
308 aa  154  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  38.3 
 
 
347 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  38.3 
 
 
306 aa  154  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  1.89293e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  38.32 
 
 
950 aa  154  6e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  39.78 
 
 
875 aa  153  9e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  37.37 
 
 
293 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  36.88 
 
 
302 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  34.02 
 
 
263 aa  152  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  34.02 
 
 
263 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.02 
 
 
263 aa  152  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.44848e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  34.02 
 
 
263 aa  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  34.02 
 
 
263 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  34.02 
 
 
263 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  38.3 
 
 
358 aa  151  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  33.69 
 
 
253 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.06968e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  33.68 
 
 
263 aa  151  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  37.24 
 
 
923 aa  150  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  34.88 
 
 
346 aa  149  2e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  34.07 
 
 
259 aa  148  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  34.55 
 
 
346 aa  147  4e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>