More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0871 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  99.59 
 
 
484 aa  939    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  74.73 
 
 
481 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  88.02 
 
 
481 aa  758    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  74.73 
 
 
476 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  74.73 
 
 
476 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  74.95 
 
 
477 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  100 
 
 
492 aa  958    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  98.97 
 
 
484 aa  933    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  48.84 
 
 
476 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  48.94 
 
 
476 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  38.05 
 
 
469 aa  276  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  38.73 
 
 
467 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  35.73 
 
 
460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  38.54 
 
 
461 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  40.26 
 
 
482 aa  236  8e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.74 
 
 
464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  38.57 
 
 
451 aa  226  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  49.81 
 
 
485 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  38.92 
 
 
455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  38.82 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.73 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  48.5 
 
 
409 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.6 
 
 
464 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.6 
 
 
464 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.6 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  34.4 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.6 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.6 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.33 
 
 
464 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.33 
 
 
464 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.6 
 
 
464 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  35.56 
 
 
452 aa  212  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  39.13 
 
 
445 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  47.04 
 
 
415 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  36.38 
 
 
483 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  38.06 
 
 
554 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  47.19 
 
 
412 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  37.47 
 
 
495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  30.22 
 
 
492 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  30.22 
 
 
492 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  39.94 
 
 
451 aa  195  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  39.71 
 
 
498 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  46.04 
 
 
449 aa  193  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.1 
 
 
471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  37.86 
 
 
466 aa  190  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  34.81 
 
 
384 aa  190  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  31.28 
 
 
471 aa  189  7e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  42.07 
 
 
407 aa  189  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  33.66 
 
 
506 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  43.02 
 
 
465 aa  188  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  27.71 
 
 
453 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  27.71 
 
 
453 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  41.8 
 
 
473 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  37.77 
 
 
402 aa  182  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.5 
 
 
440 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  35.31 
 
 
428 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  45.82 
 
 
424 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  41.7 
 
 
425 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  29.58 
 
 
456 aa  177  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  41.26 
 
 
403 aa  176  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  42.19 
 
 
451 aa  176  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  33.43 
 
 
452 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  33.59 
 
 
452 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  33.89 
 
 
469 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  38.49 
 
 
395 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  32.23 
 
 
452 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  41.84 
 
 
391 aa  171  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  37.84 
 
 
473 aa  171  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  31.07 
 
 
477 aa  171  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  31.56 
 
 
482 aa  169  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  31.96 
 
 
452 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  36.72 
 
 
447 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  31.96 
 
 
452 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  32.77 
 
 
414 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  38.85 
 
 
391 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  32.49 
 
 
473 aa  168  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.46 
 
 
435 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  31.78 
 
 
452 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  43.24 
 
 
394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  37.55 
 
 
418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  31.4 
 
 
452 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  38.08 
 
 
391 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  48.65 
 
 
467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  38.08 
 
 
391 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  42.05 
 
 
425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  37.31 
 
 
465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  41.58 
 
 
484 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  37.63 
 
 
490 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  38.08 
 
 
391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  39.08 
 
 
435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  38.08 
 
 
391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  38.08 
 
 
391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  37.07 
 
 
395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  38.08 
 
 
391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  38.08 
 
 
391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  38.08 
 
 
391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  38.25 
 
 
386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  32.87 
 
 
473 aa  163  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  42.08 
 
 
259 aa  163  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  36.22 
 
 
406 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>