152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0805 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  34.52 
 
 		 1164 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  99.83 
 
 		 1147 aa  2321    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  100 
 
 		 1104 aa  2235    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  97.69 
 
 		 1164 aa  2258    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0730  hypothetical protein  99.86 
 
 		 728 aa  1485    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000967191  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0731  hypothetical protein  99.76 
 
 		 443 aa  735    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00636077  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  99.91 
 
 		 1167 aa  2362    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  100 
 
 		 1167 aa  2363    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  100 
 
 		 1167 aa  2363    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  99.91 
 
 		 1167 aa  2362    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1164 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  26.53 
 
 		 1199 aa  320  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1176 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  24 
 
 		 1212 aa  311  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1208 aa  308  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  25.97 
 
 		 1171 aa  298  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  25.76 
 
 		 1209 aa  296  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  26.26 
 
 		 1209 aa  294  7e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  26.26 
 
 		 1209 aa  294  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  26.26 
 
 		 1209 aa  294  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  26.26 
 
 		 1209 aa  294  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  27.58 
 
 		 1220 aa  292  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  26.26 
 
 		 1209 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  26.26 
 
 		 1209 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  26.26 
 
 		 1209 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1205 aa  291  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  25.39 
 
 		 1209 aa  290  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1102 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  25.88 
 
 		 1218 aa  284  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  25.63 
 
 		 1329 aa  263  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  23.67 
 
 		 1207 aa  262  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1369 aa  250  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1332 aa  249  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  26.36 
 
 		 1365 aa  245  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  28.37 
 
 		 1211 aa  244  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  25.59 
 
 		 1317 aa  242  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  24.47 
 
 		 1268 aa  239  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  22.6 
 
 		 1172 aa  237  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  26.43 
 
 		 1366 aa  231  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  25.77 
 
 		 1348 aa  222  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  26.63 
 
 		 1365 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  22.18 
 
 		 1182 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  23.1 
 
 		 1275 aa  212  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1275 aa  212  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  20.8 
 
 		 1181 aa  208  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  27.13 
 
 		 1358 aa  204  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  27.13 
 
 		 1358 aa  204  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  27.13 
 
 		 1358 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  26.58 
 
 		 1302 aa  196  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  26.29 
 
 		 1302 aa  195  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  25.93 
 
 		 1302 aa  195  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  26.44 
 
 		 1302 aa  193  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  26.29 
 
 		 1302 aa  192  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  24.5 
 
 		 1175 aa  191  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  26.24 
 
 		 1302 aa  190  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  25.02 
 
 		 1152 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  23.15 
 
 		 1150 aa  180  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  23.58 
 
 		 1179 aa  180  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1192 aa  177  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  21.12 
 
 		 1187 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1179 aa  173  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  23.8 
 
 		 1206 aa  171  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1208 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1175 aa  164  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1206 aa  164  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1174 aa  164  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  21.91 
 
 		 1181 aa  163  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1008 aa  160  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  21.86 
 
 		 1182 aa  160  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  23.78 
 
 		 1194 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1174 aa  160  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  24.09 
 
 		 1205 aa  157  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  22.49 
 
 		 1148 aa  155  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1168 aa  152  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  22.48 
 
 		 1177 aa  151  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  22.48 
 
 		 1177 aa  151  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  21.95 
 
 		 1165 aa  151  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  22.32 
 
 		 1153 aa  150  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1153 aa  148  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  21.72 
 
 		 1165 aa  147  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000435  IcmF-related protein  22 
 
 		 1130 aa  144  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.127342  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  22.4 
 
 		 1165 aa  139  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  24.81 
 
 		 1157 aa  134  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0929  SciS protein  26.38 
 
 		 431 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1216  hypothetical protein  26.38 
 
 		 431 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1173 aa  115  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  23.1 
 
 		 1164 aa  114  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  24.96 
 
 		 1173 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  21 
 
 		 1129 aa  111  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  23.44 
 
 		 1204 aa  110  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  21.08 
 
 		 1230 aa  103  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  23.22 
 
 		 1176 aa  97.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0500  hypothetical protein  22.07 
 
 		 973 aa  96.3  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 1194 aa  96.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0524  hypothetical protein  21.47 
 
 		 973 aa  95.1  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  21.39 
 
 		 1288 aa  94.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2138  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1328 aa  92  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2040  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1334 aa  90.1  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0549  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1299 aa  89.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553275  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  26.55 
 
 		 1289 aa  89  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>