More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0456 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  99.03 
 
 
835 aa  611  1e-174  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  100 
 
 
310 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  99.35 
 
 
310 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2075  carbohydrate ABC transporter permease  89.68 
 
 
279 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1102  carbohydrate ABC transporter permease  89.35 
 
 
298 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1813  sugar ABC transporter, permease protein  89.35 
 
 
294 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429209  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0811  carbohydrate ABC transporter permease  89.35 
 
 
294 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  76.9 
 
 
325 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  74.92 
 
 
308 aa  428  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  64.38 
 
 
342 aa  338  7e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  58.73 
 
 
334 aa  322  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  58.28 
 
 
334 aa  319  4e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  58.28 
 
 
334 aa  319  4e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4580  monosaccharide-transporting ATPase  65.58 
 
 
326 aa  303  2e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  58.01 
 
 
334 aa  302  4e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  53.27 
 
 
334 aa  292  6e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  53.27 
 
 
342 aa  291  9e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  53.27 
 
 
342 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  51.08 
 
 
345 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  49.51 
 
 
320 aa  262  5e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.13624e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  50.85 
 
 
311 aa  261  9e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  49.04 
 
 
350 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  49.19 
 
 
311 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  50.51 
 
 
311 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  50.51 
 
 
311 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  48.86 
 
 
311 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  49.66 
 
 
324 aa  259  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  48.86 
 
 
311 aa  259  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  48.86 
 
 
311 aa  259  5e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  48.86 
 
 
311 aa  259  5e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  48.86 
 
 
311 aa  259  5e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  48.29 
 
 
338 aa  258  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  46.98 
 
 
324 aa  258  9e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  48.53 
 
 
311 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.30424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  51.85 
 
 
322 aa  256  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  46.45 
 
 
311 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  50.34 
 
 
311 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.52632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  53.51 
 
 
324 aa  254  1e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  53.04 
 
 
322 aa  254  1e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  52.82 
 
 
322 aa  254  2e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  51.66 
 
 
322 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  50.67 
 
 
327 aa  251  9e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  50.51 
 
 
323 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  45.71 
 
 
346 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  50.67 
 
 
327 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  44.9 
 
 
331 aa  249  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  51.19 
 
 
314 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  53.16 
 
 
321 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  53.16 
 
 
321 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  52.03 
 
 
322 aa  248  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  53.16 
 
 
321 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  53.16 
 
 
321 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  53.16 
 
 
321 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  43.56 
 
 
314 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  53.16 
 
 
321 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  52.82 
 
 
321 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  52.82 
 
 
321 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  52.82 
 
 
321 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  52.82 
 
 
321 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  52.82 
 
 
321 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  52.82 
 
 
321 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  52.82 
 
 
321 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  52.82 
 
 
321 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  45.21 
 
 
306 aa  246  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  53.04 
 
 
321 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  7.74907e-07 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  45.73 
 
 
330 aa  246  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  6.2023e-05 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  45.73 
 
 
330 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  50.84 
 
 
313 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  45.73 
 
 
330 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  48.94 
 
 
309 aa  243  2e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  46.13 
 
 
318 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  43.69 
 
 
312 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  46.53 
 
 
332 aa  239  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  50.32 
 
 
319 aa  239  6e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  47.74 
 
 
310 aa  238  7e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  46.89 
 
 
328 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  47.18 
 
 
348 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  47.24 
 
 
310 aa  236  5e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  45.4 
 
 
343 aa  236  5e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  50.85 
 
 
336 aa  235  6e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  45.08 
 
 
343 aa  234  2e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  42.52 
 
 
309 aa  232  5e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  44.79 
 
 
342 aa  231  9e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  43.77 
 
 
310 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  43.71 
 
 
331 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  43.23 
 
 
331 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  44.37 
 
 
325 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  45.15 
 
 
336 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  43.79 
 
 
336 aa  229  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  45.8 
 
 
322 aa  228  7e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  47.28 
 
 
341 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  42.81 
 
 
333 aa  228  1e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  44.37 
 
 
330 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  44.37 
 
 
330 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  44.37 
 
 
330 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  46.62 
 
 
325 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  43.05 
 
 
320 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2034  Monosaccharide-transporting ATPase  50 
 
 
326 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0584323  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  47.59 
 
 
335 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  44.72 
 
 
322 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>