94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0341 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  99.18 
 
 
367 aa  704    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  99.13 
 
 
345 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  99.18 
 
 
367 aa  704    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  99.46 
 
 
367 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  100 
 
 
367 aa  711    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  99.18 
 
 
367 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  94.86 
 
 
371 aa  577  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  71.55 
 
 
365 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  61.35 
 
 
361 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  64.43 
 
 
368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  61.58 
 
 
361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  59.2 
 
 
372 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  56.91 
 
 
367 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  57.58 
 
 
372 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  46.15 
 
 
347 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  46.24 
 
 
360 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  46.15 
 
 
351 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  46.15 
 
 
349 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  46.15 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  43.39 
 
 
356 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  44.77 
 
 
354 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  41.97 
 
 
356 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  41.97 
 
 
356 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  43.57 
 
 
356 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  44.74 
 
 
352 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  28.75 
 
 
393 aa  166  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  29.31 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  29.31 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  33.24 
 
 
354 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  32.55 
 
 
345 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  29.85 
 
 
346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  32.54 
 
 
345 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.38 
 
 
343 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.65 
 
 
339 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  27.6 
 
 
341 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  39.74 
 
 
359 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  39.3 
 
 
359 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  39.3 
 
 
359 aa  99.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  39.3 
 
 
359 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  39.3 
 
 
359 aa  99.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  39.3 
 
 
359 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  39.3 
 
 
359 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  31.66 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.97 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  28.61 
 
 
342 aa  97.1  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  42.52 
 
 
344 aa  91.3  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  31.64 
 
 
340 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  32.5 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  41.3 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  27.89 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  25.14 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  33.81 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  33.81 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  27.11 
 
 
365 aa  62.8  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  26.79 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  28.22 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  28.32 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  28.32 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  28.32 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  28.32 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  28.02 
 
 
373 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  28.02 
 
 
373 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  28.02 
 
 
373 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  24.04 
 
 
363 aa  53.5  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  24.29 
 
 
366 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  27.57 
 
 
369 aa  53.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  27.06 
 
 
371 aa  53.1  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.14 
 
 
373 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  27.14 
 
 
373 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  26.36 
 
 
373 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.63 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  28.26 
 
 
314 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  26.29 
 
 
373 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  26.29 
 
 
373 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  29.91 
 
 
530 aa  49.7  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  30.48 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  30.48 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0764  ImpA domain-containing protein  20.97 
 
 
337 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00810517  normal  0.0303687 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  26.09 
 
 
312 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  27.79 
 
 
383 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3437  ImpA domain-containing protein  20.97 
 
 
337 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00156719  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2073  hypothetical protein  26.09 
 
 
300 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0699  ImpA-related N-terminal family protein  26.09 
 
 
312 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3566  ImpA domain-containing protein  20.97 
 
 
328 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.3 
 
 
439 aa  46.2  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  29.41 
 
 
534 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  28.69 
 
 
524 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  32.04 
 
 
523 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  30.09 
 
 
527 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  25.87 
 
 
371 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.81 
 
 
439 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  28.85 
 
 
528 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  24.75 
 
 
337 aa  43.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  24.78 
 
 
361 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>