113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0239 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0239  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 
241 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0186  flagellar basal body rod modification protein  96.97 
 
 
231 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4673  flagellar basal body rod modification protein  47.44 
 
 
241 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795242 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04911  flagellar basal body rod modification protein  37.82 
 
 
228 aa  135  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000738  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  37.69 
 
 
227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0208  flagellar basal body rod modification protein  37.91 
 
 
225 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.577619 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0265  lateral flagellar rod protein LfgD  35.71 
 
 
237 aa  121  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3369  flagellar hook capping protein  35.71 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0641  flagellar basal body rod modification protein  35.33 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0225  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
218 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0721  flagellar basal body rod modification protein  32.84 
 
 
218 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  30.91 
 
 
220 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3576  flagellar basal body rod modification protein  31.16 
 
 
230 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  31.82 
 
 
220 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0073  flagellar hook capping protein  30.58 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  29.33 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  30.27 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  31.03 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  31.03 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  28.27 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  31.44 
 
 
221 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  32.2 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  32.2 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  28.04 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  34.16 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  33.54 
 
 
216 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  29.95 
 
 
225 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  30.18 
 
 
225 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  29.95 
 
 
225 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  29.53 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  27.44 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  28.79 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  29.8 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  30.63 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  31.47 
 
 
226 aa  59.3  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  30.89 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  24.75 
 
 
238 aa  58.5  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  27.33 
 
 
222 aa  58.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  31.09 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  29.38 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  27.62 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  27.62 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  29.51 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  29.82 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  32.64 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  27.13 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  26.56 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  26.56 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  28.79 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  29.22 
 
 
229 aa  55.5  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  29.76 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  28.19 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  28.19 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  29.14 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  28.28 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  28.19 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  34.84 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  26.85 
 
 
251 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  28.86 
 
 
278 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  27.52 
 
 
247 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  32.9 
 
 
221 aa  52.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  28.19 
 
 
277 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  28.19 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  27.32 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  28.19 
 
 
277 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  28.19 
 
 
277 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  28.19 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  28.19 
 
 
280 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  28.19 
 
 
277 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  29.41 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  32.88 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  26.32 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  28.93 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  31.97 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  29.8 
 
 
221 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  28.33 
 
 
245 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  28.57 
 
 
248 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  28.38 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  28.57 
 
 
248 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  30 
 
 
223 aa  49.3  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  24.63 
 
 
225 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  26.7 
 
 
293 aa  49.3  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  31.25 
 
 
220 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  29.26 
 
 
218 aa  48.9  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  26.71 
 
 
222 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  29.88 
 
 
230 aa  48.5  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  30.21 
 
 
235 aa  48.5  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  26.84 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  26.46 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  26.77 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  31.48 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  27.63 
 
 
222 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  24.84 
 
 
224 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  28.16 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1670  flagellar hook capping protein  27.27 
 
 
225 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166978  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2732  flagellar hook capping protein  29.33 
 
 
224 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000455072 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  29.17 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  28.77 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  28.57 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  28.44 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>