More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0166 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
858 aa  1459    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  85.06 
 
 
1048 aa  1239    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  47.78 
 
 
922 aa  661    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  98.75 
 
 
872 aa  1441    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
896 aa  1459    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
930 aa  1840    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  47.78 
 
 
874 aa  661    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  47.78 
 
 
916 aa  661    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  85.61 
 
 
1057 aa  1253    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  45.7 
 
 
725 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  45.18 
 
 
676 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  43.15 
 
 
724 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  48.96 
 
 
775 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  48.96 
 
 
775 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  48.96 
 
 
775 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  48.96 
 
 
775 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  42.44 
 
 
714 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  48.96 
 
 
775 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  48.96 
 
 
775 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  43.21 
 
 
729 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  48.96 
 
 
775 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  43.27 
 
 
730 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  43.05 
 
 
729 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  47.04 
 
 
1981 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  43.35 
 
 
743 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  40.95 
 
 
794 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  49.04 
 
 
540 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  43.81 
 
 
1048 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  42.47 
 
 
822 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  42.63 
 
 
845 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  43.52 
 
 
843 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  43.32 
 
 
845 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  40.82 
 
 
826 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  44.22 
 
 
862 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  44.04 
 
 
862 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  37.87 
 
 
731 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  37.67 
 
 
734 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  37.67 
 
 
734 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  37.67 
 
 
734 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  37.67 
 
 
731 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  37.67 
 
 
734 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  37.67 
 
 
734 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  37.67 
 
 
734 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  42.88 
 
 
1284 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  36.54 
 
 
777 aa  402  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  37.07 
 
 
780 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  35.42 
 
 
734 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  36.02 
 
 
646 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  41.59 
 
 
796 aa  396  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  33.38 
 
 
748 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  35.15 
 
 
734 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  36.14 
 
 
643 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  33.21 
 
 
774 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  38.12 
 
 
757 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  34.55 
 
 
788 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  33.87 
 
 
741 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  35.1 
 
 
778 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  34.84 
 
 
741 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  33.73 
 
 
741 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  33.52 
 
 
712 aa  382  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  33.96 
 
 
755 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  33.96 
 
 
756 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  34.98 
 
 
645 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  34.05 
 
 
730 aa  376  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  35.65 
 
 
689 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  35.68 
 
 
689 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  35.3 
 
 
785 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  34.27 
 
 
794 aa  373  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  38.54 
 
 
907 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  34.25 
 
 
792 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  40.3 
 
 
1284 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  37.88 
 
 
767 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  37.88 
 
 
767 aa  364  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  38.01 
 
 
572 aa  363  7.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  34.31 
 
 
771 aa  361  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  34.59 
 
 
683 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  38.55 
 
 
901 aa  352  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  34.94 
 
 
683 aa  351  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  37.22 
 
 
975 aa  348  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  37.4 
 
 
841 aa  347  6e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  37.4 
 
 
841 aa  347  7e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  36.75 
 
 
889 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  37.71 
 
 
886 aa  346  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  37.52 
 
 
838 aa  346  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  33.89 
 
 
735 aa  342  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  37.96 
 
 
769 aa  338  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  36.45 
 
 
841 aa  339  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  34.83 
 
 
783 aa  337  7e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  36.62 
 
 
837 aa  333  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  36.25 
 
 
920 aa  333  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  36.62 
 
 
885 aa  333  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  36.62 
 
 
918 aa  332  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  34.13 
 
 
697 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  33.68 
 
 
661 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  36.19 
 
 
618 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  34.1 
 
 
687 aa  325  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  33.53 
 
 
661 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  33.53 
 
 
661 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  33.53 
 
 
661 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  33.53 
 
 
661 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>