86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0160 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  100 
 
 
210 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  98.89 
 
 
180 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  93.89 
 
 
180 aa  347  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  61.45 
 
 
180 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  59.44 
 
 
179 aa  216  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  44.65 
 
 
172 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  43.98 
 
 
166 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  47.68 
 
 
167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  45.16 
 
 
167 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  43.67 
 
 
170 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  40.52 
 
 
163 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  40.52 
 
 
163 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  40.52 
 
 
163 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  40.52 
 
 
163 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  44.76 
 
 
168 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  45.39 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  45.39 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  45.39 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  45.39 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  41.29 
 
 
168 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  45.39 
 
 
167 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  45.39 
 
 
167 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  45.39 
 
 
167 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  35.1 
 
 
191 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  35.1 
 
 
172 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  35.1 
 
 
172 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  35.1 
 
 
179 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  35.1 
 
 
172 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  35.1 
 
 
172 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  35.1 
 
 
172 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  36.5 
 
 
156 aa  98.6  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  37.6 
 
 
172 aa  97.8  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  39.34 
 
 
160 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  38.79 
 
 
166 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  34.13 
 
 
154 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  35.9 
 
 
166 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  32.09 
 
 
171 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  34.13 
 
 
154 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  37.5 
 
 
168 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  37.5 
 
 
168 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  33.56 
 
 
192 aa  89  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  34.35 
 
 
155 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  29.77 
 
 
162 aa  87.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  35.04 
 
 
171 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  33.09 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  30.71 
 
 
163 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  36.79 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  34.04 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  37.76 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000378046 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  30.3 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  30.3 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  30.3 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  28.79 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  28.37 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  31.93 
 
 
156 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05853  hypothetical protein  31.53 
 
 
149 aa  62  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  26.19 
 
 
164 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  27.86 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  27.5 
 
 
154 aa  54.3  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  26.5 
 
 
158 aa  52.4  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  28.69 
 
 
163 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  26.02 
 
 
154 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000258047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  26.55 
 
 
251 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  27.69 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  30.7 
 
 
172 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  26.92 
 
 
193 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  27.78 
 
 
202 aa  48.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  26.92 
 
 
193 aa  48.5  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000478166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0802  hypothetical protein  30.3 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  31.25 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  24.14 
 
 
157 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  28.12 
 
 
212 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  24.53 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  24.53 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2179  putative lipoprotein  25 
 
 
189 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000218689  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  24.53 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  24.53 
 
 
292 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  27.27 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  28.57 
 
 
176 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2467  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  26.67 
 
 
164 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  23.58 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000403231  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3243  hypothetical protein  29.63 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.795372  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  27.47 
 
 
189 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  24.14 
 
 
190 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1802  hypothetical protein  26.09 
 
 
181 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.56234  normal  0.0484163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  26.04 
 
 
177 aa  41.6  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>