More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3699 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  89.69 
 
 
359 aa  653  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
359 aa  722  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  89.69 
 
 
359 aa  653  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  89.42 
 
 
359 aa  652  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  89.66 
 
 
359 aa  647  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  90.25 
 
 
359 aa  655  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
359 aa  722  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
359 aa  722  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  90.25 
 
 
359 aa  655  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
359 aa  722  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
359 aa  722  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
359 aa  722  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
359 aa  722  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  96.65 
 
 
358 aa  696  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  87.92 
 
 
361 aa  627  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0296  3-dehydroquinate synthase  89.14 
 
 
359 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  86.27 
 
 
363 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  86.8 
 
 
361 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  3.86379e-08 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  72.96 
 
 
368 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  70.9 
 
 
368 aa  506  1e-142  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  70.9 
 
 
368 aa  505  1e-142  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  70.62 
 
 
368 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  70.9 
 
 
368 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  63.59 
 
 
361 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  64.15 
 
 
361 aa  470  1e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  66.2 
 
 
359 aa  467  1e-130  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  67.05 
 
 
370 aa  458  1e-128  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  63.56 
 
 
370 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  62.39 
 
 
372 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2926  3-dehydroquinate synthase  63.92 
 
 
368 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  63.25 
 
 
367 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  63.25 
 
 
367 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  62.85 
 
 
373 aa  431  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  62.75 
 
 
372 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  60.97 
 
 
361 aa  425  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  60.96 
 
 
367 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  62.97 
 
 
364 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  59.89 
 
 
373 aa  424  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  58.73 
 
 
365 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0787  3-dehydroquinate synthase  62.36 
 
 
388 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  61.84 
 
 
376 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  59.56 
 
 
365 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  59.83 
 
 
365 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0840  3-dehydroquinate synthase  64.33 
 
 
360 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  59.56 
 
 
368 aa  415  1e-115  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  59.28 
 
 
376 aa  417  1e-115  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  59.25 
 
 
366 aa  414  1e-115  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  59 
 
 
368 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  58.77 
 
 
362 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  58.17 
 
 
367 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  60.11 
 
 
361 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  59.44 
 
 
365 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  56.69 
 
 
358 aa  408  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  58.73 
 
 
366 aa  407  1e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  58.45 
 
 
367 aa  400  1e-110  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  55.24 
 
 
359 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  55 
 
 
358 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  56.51 
 
 
359 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  58.45 
 
 
367 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  56.82 
 
 
359 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  56.37 
 
 
368 aa  387  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  55.18 
 
 
364 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  55.81 
 
 
368 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02611e-06 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  55.18 
 
 
364 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0016  3-dehydroquinate synthase  58.4 
 
 
373 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691661  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  55.59 
 
 
359 aa  378  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.55339e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  56.8 
 
 
366 aa  376  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  55.59 
 
 
359 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  54.68 
 
 
359 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  55.59 
 
 
359 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  53.89 
 
 
359 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  8.20021e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  53.74 
 
 
374 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  52.68 
 
 
354 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  55.29 
 
 
359 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.15633e-06  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  55.11 
 
 
350 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  55.72 
 
 
362 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  53.26 
 
 
366 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.50156e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  55.72 
 
 
362 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  2.89356e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  55.72 
 
 
362 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  54.79 
 
 
358 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  3.35612e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  55.72 
 
 
362 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  55.72 
 
 
362 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  54.49 
 
 
358 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  4.11195e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  54.04 
 
 
366 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.60296e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  54.49 
 
 
358 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  7.46069e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  53.53 
 
 
358 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  53.89 
 
 
358 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.0907e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  51.27 
 
 
356 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  52.66 
 
 
361 aa  364  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  55.24 
 
 
364 aa  364  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  52.56 
 
 
358 aa  364  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  50.7 
 
 
355 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  2.91417e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  57.14 
 
 
354 aa  363  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  51.4 
 
 
366 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  55.59 
 
 
362 aa  362  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  6.35548e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  55.59 
 
 
362 aa  362  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.54309e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  55.59 
 
 
362 aa  362  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.54886e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  51.55 
 
 
358 aa  361  9e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  58.04 
 
 
388 aa  361  1e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  54.73 
 
 
369 aa  361  1e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>