147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3640 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  98.08 
 
 
261 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0398  hypothetical protein  88.51 
 
 
260 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  88.51 
 
 
260 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  88.12 
 
 
260 aa  470  1e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2643  hypothetical protein  87.36 
 
 
260 aa  468  1e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0441  hypothetical protein  87.74 
 
 
260 aa  470  1e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31423  normal  0.269531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  87.36 
 
 
260 aa  467  1e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0463  hypothetical protein  87.36 
 
 
260 aa  468  1e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  82.76 
 
 
260 aa  452  1e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  64.23 
 
 
263 aa  345  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  55.17 
 
 
257 aa  295  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  57.33 
 
 
262 aa  264  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  37.26 
 
 
238 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  37.32 
 
 
238 aa  145  8e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2263  hypothetical protein  37.98 
 
 
237 aa  145  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  38.21 
 
 
237 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  37.26 
 
 
238 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  36.95 
 
 
238 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  28.29 
 
 
429 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  32.9 
 
 
453 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  30.05 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  30.24 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  34.67 
 
 
449 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  30.77 
 
 
449 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  30.94 
 
 
438 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  30.94 
 
 
438 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  30.94 
 
 
438 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  30.94 
 
 
438 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  30.94 
 
 
437 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  30.94 
 
 
438 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  30.94 
 
 
438 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  30.94 
 
 
438 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.43 
 
 
442 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  30.94 
 
 
440 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  26.12 
 
 
452 aa  85.5  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  29.59 
 
 
406 aa  85.5  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  29.13 
 
 
289 aa  85.1  1e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  29.13 
 
 
289 aa  85.1  1e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  27.59 
 
 
290 aa  84.3  2e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  28.22 
 
 
291 aa  83.2  4e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  29.19 
 
 
430 aa  83.2  4e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  27.45 
 
 
413 aa  82.8  5e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  26.14 
 
 
443 aa  81.3  1e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  27.72 
 
 
291 aa  80.9  2e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  25.09 
 
 
430 aa  76.3  4e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 
456 aa  73.2  4e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  29.25 
 
 
460 aa  72  8e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  25.6 
 
 
273 aa  70.9  2e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1204  type IV / VI secretion system protein, DotU family  32.79 
 
 
219 aa  69.3  6e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3165  hypothetical protein  30.82 
 
 
264 aa  68.9  7e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  25.1 
 
 
282 aa  68.9  9e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  22.81 
 
 
261 aa  68.6  1e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3046  hypothetical protein  31.97 
 
 
219 aa  68.2  1e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  24.59 
 
 
460 aa  67.8  2e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6515e-06 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  28.92 
 
 
426 aa  67.4  2e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  26.18 
 
 
453 aa  67.8  2e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  28.92 
 
 
421 aa  67  3e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  28.57 
 
 
257 aa  67  3e-10  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  28.92 
 
 
421 aa  67  3e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  28.57 
 
 
257 aa  67  3e-10  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  28.92 
 
 
421 aa  67  3e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  28.92 
 
 
421 aa  67  3e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  28.92 
 
 
421 aa  67  3e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  28.92 
 
 
421 aa  66.6  3e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  26.49 
 
 
453 aa  66.2  5e-10  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  24.46 
 
 
282 aa  65.9  7e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  25.82 
 
 
469 aa  65.5  8e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.24 
 
 
489 aa  64.7  1e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  29.09 
 
 
434 aa  65.1  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  29.09 
 
 
434 aa  65.1  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  34.75 
 
 
226 aa  65.1  1e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  29.09 
 
 
434 aa  65.1  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  26.53 
 
 
463 aa  64.3  2e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  25.45 
 
 
374 aa  63.9  2e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  25 
 
 
443 aa  63.5  3e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  28.48 
 
 
434 aa  63.5  3e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  30 
 
 
215 aa  63.2  5e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  26.4 
 
 
438 aa  62.8  6e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3647  hypothetical protein  26.54 
 
 
224 aa  62.8  6e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  23.33 
 
 
290 aa  62  9e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  23.98 
 
 
494 aa  62  9e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  22.78 
 
 
289 aa  61.6  1e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  33.63 
 
 
263 aa  60.1  3e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  35.88 
 
 
215 aa  60.5  3e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  21.9 
 
 
289 aa  60.1  3e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0164  hypothetical protein  40.43 
 
 
237 aa  60.5  3e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.431152  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000429  ImpK/VasF outer membrane protein  33.63 
 
 
263 aa  59.3  5e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  28.65 
 
 
275 aa  59.3  6e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1179  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B (Asp/Glu-ADT subunit B)  28.16 
 
 
254 aa  59.3  6e-08  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  34.51 
 
 
226 aa  58.9  9e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  21.7 
 
 
289 aa  58.5  1e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  23.35 
 
 
258 aa  57.8  2e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.17 
 
 
258 aa  57  3e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  22.73 
 
 
282 aa  57.4  3e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  30.23 
 
 
221 aa  56.6  3e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  26.34 
 
 
434 aa  56.6  4e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50770  hypothetical protein  37.8 
 
 
254 aa  56.2  5e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.203271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>